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原创 GO和KEGG富集结果GeneID是entrzID转Symbol

摘要：本文介绍了使用R语言进行KEGG通路富集分析及可视化方法。首先利用clusterProfiler包对基因进行ID转换和KEGG富集分析，输出柱状图和气泡图展示富集结果；随后通过GOplot包绘制KEGG圈图（Chord图）和聚类图，可视化基因与通路的关联关系。分析过程包括读取基因ID文件、去除无效ID、ENTREZID转换、富集分析（p<0.05）、结果保存和可视化图表输出（PDF格式）。可视化参数可调节图表尺寸、字体大小、颜色等，其中圈图可展示基因表达变化与通路的关联模式。

2025-06-17 16:18:01 362

原创解决AutodockTool（ADT）工作路径修改后打开不了的问题

Autodock、分子对接、AutodockTool、工作目录、软件打开失败

2025-03-24 21:05:41 530

原创右键新增文件打开方式

yes

2025-03-07 02:01:56 136

原创 R语言（ing）：单基因ROC分析

【代码】R语言（ing）：单基因ROC分析。

2025-02-23 20:47:05 364

原创 R语言：免疫细胞基因（彩虹/多重t/相关热/相关散）

复制文件：22种免疫细胞的比例肿瘤患者表达谱。

2025-02-23 07:08:59 612

原创 R语言：GSEA

单基因BRK进行差异分析后。

2025-02-23 04:59:00 492

原创 R语言：COX生存分析

【代码】R语言：COX生存分析。

2025-02-23 03:47:46 351

原创 R语言：热图绘制

【代码】R语言：热图绘制。

2025-02-23 02:43:09 501

原创 R语言：单基因の差异分析

清洗数据＆完整代码【分组：测序文件】

2025-02-23 02:24:12 416

原创 R语言xc：整理TCGA临床信息（方差分析）

知识来源于B站

2025-02-23 01:39:48 485

原创 R语言：计算患者免疫评分与肿瘤纯度

知识来源于B站

2025-02-23 00:59:05 464

原创 R语言：TCGA生存分析

学习内容来源于B站

2025-02-23 00:57:41 726 1

原创 R语言：清洗TCGA数据（标准化，细节看非标准化那篇）

将转变为创建工作目录，复制这两个文件进去。

2025-02-22 22:05:15 638 1

原创 R语言：清洗TCGA数据（没有标准化，可不用）

将转变为创建工作目录，复制这两个文件进去。luad.gdc_2022.rda文件得到expquery2数据。

2025-02-22 21:28:30 877

原创 R语言：从TCGA数据库下载数据集

只需要保留此文件即可,其它删除。（漫长的等待......）（漫长的等待......）

2025-02-22 06:42:39 1593

原创三种聚类算法（K-means,AGNES,DBScan）的python实现

文章出自“浪客竹马”，本人进行二次加工与学习。

2023-12-02 11:39:06 214

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