
研究生活
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研究生活的代码记录
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泼墨吹烛,我自赏遍红尘蒹葭,点笔寒桠,为你温纸入画。
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Markdown语法使用方法在优快云中的写法
Markdown语法原创 2023-02-07 14:50:29 · 860 阅读 · 0 评论 -
给定空间的四个点的笛卡尔积坐标,使用python、shell计算二面角
其中A,B,C,D是以列表形式给出的直角坐标 (例如: A = [x, y, z] )给出4个原子的坐标A、B、C、D(应该是笛卡尔坐标,内坐标的话也就不需要算了)注意4个原子的顺序(这涉及到二面角的大小,正负,可以参考各种分子可视化软件的选择二面角方法)求三个向量a = B-A, b = C-B, c = D-C(这一步需要注意减法的顺序,因为这决定了向量的方向,从而决定了平面法向量的方向)使用数学上向量的方法叉乘,n1=a×b,n2=b×c;原创 2022-10-28 22:07:21 · 613 阅读 · 0 评论 -
学术论文搜索相关的网址推荐
作为一家非营利机构,Annual Reviews出版社旨在促进科学和社会进步,我们希望这一举措,能帮科研工作者在查阅文献时,节省一点宝贵的时间。Annual Reviews 出版社于 1932 年成立于美国加州,由斯坦福大学教授 J. Murray Luck 创办,专注于出版综述期刊,期刊内容涵盖生物学、医学、自然科学、农学和社会科学等多个学科领域。Annual Reviews的综述都是由各个领域的顶尖学者撰写,代表了学科发展的前沿,极具专业性。原创 2022-10-02 17:44:48 · 563 阅读 · 0 评论 -
关于训练时,最后一轮batch_size=1的报错
当Batch Normalization设为训练模式时(通过训练样本学习均值和方差),拒绝任何batch-size为1的情况。至于原因,简单地说就是BN归一化是依靠当前mini-batch的均值和方差进行归一化的,如果batch-size太小,显然所谓的均值和方差并不能代表不同sample之间的差距,各个mini-batch归一化结果的差异会非常大,归一化就没有意义了。另外,当batch-size设为1时,BN的结果近似于IN。,还有一种情况就是,在最后一轮的时候。基本上现在不会直接设置。原创 2022-10-01 21:23:30 · 3029 阅读 · 0 评论 -
在服务器(CentOS系统)上安装chimera
UCSF Chimera是一个可高度延伸的程序,用于分子结构和相关数据的交互式可视化和 分析。主要包括:密度图,超分子组合,顺序排列,对接结果,轨迹和构象ensemble。也可以生成高质量图像和动画。Chimera包括完整的程序说明书和几个教程。原创 2022-09-22 18:33:45 · 985 阅读 · 0 评论 -
TensorFlow
下载Anaconda的地址:官网http://www.continuum.io/downloads/也可以在https://repo.continuum.io/archive/ 选择相应的版本下载。2)激活tensorflow环境,然后使用其中的 pip 安装 TensorFlow。4、安装完成之后配置环境变量,然后安装Anaconda Python3.5环境。3、安装提示,直接回车下一步,选择License文档,按q键,最后yes确认。归根结底问题:由于Linux内核不支持,版本太低!原创 2022-08-23 08:30:14 · 1828 阅读 · 0 评论 -
图神经网络:GAT学习、理解、入坑
图神经网络-GAT网络了解原创 2022-07-18 22:13:25 · 7029 阅读 · 0 评论 -
Java笔记24-Java高级编程部分-第十六章-Java8的其他特性
第16章:Java8的其他特性目录注:Nashorn,发音"nass-horn",是德国二战时一个坦克的命名,同时也是java8新一代的javascript引擎。javascript运行在ym已经不是新鲜事了,Rhino早在jdkc的时候已经存在,但现在为何要替代Rhino ,官方的解释是Rhino相比其他avescripte撑(比加oogle的V8 )实在大憬了,要改造Rhino还不如重写。所以Nashorn的性能也是其一个亮点。1.Lambda表达式P6682.函原创 2022-05-31 22:54:40 · 216 阅读 · 0 评论 -
如何使用Adobe Acrobat DC统一页面大小?
一、问题描述 在扫描完文件以后,保存为图片格式,不过在将图片合并成pdf文件后,就发现页面大小不一样了。也就是有的页面比较大有的比较小,就比较不舒服,也不符合规范,想着怎么样让他都变成一样的格式呐?二、解决方法好多方法都是用的打印的方式,不是太好感觉,选择用Adobe自带的功能可能会好一些;点击工具或者更多工具打开印刷制作–> 选择里面的印前检查在印前检查里面–>1.选择库—Acrobat Pro DC 2015配置文件–> 2.PDF修正–>3. 将页面缩原创 2022-05-31 15:42:06 · 26770 阅读 · 13 评论 -
服务器中使用Top命令后,参数解释
一、问题描述 top命令是最方便可用的服务器监控命令,可以看出服务器的当前负载量,CPU占用率,内存占用率等重要信息。展示两种情景:情景一:top命令即可;要是想要退出就按q即可情景二:在情景一的基础上按一下1,数字1即可;在按1即可回到情景二; 看的头大,这都是啥啊!赶紧查一波!整理一下吧。二、top命令详解下面详细解说一下top命令里面的各个指标:1. 系统概况top - 17:53:48 up 341 days, 19:35, 4 users, load average:原创 2022-05-26 11:28:08 · 3573 阅读 · 0 评论 -
论文封面标题下划线制作
一、问题描述 学校发的模板在填写信息的时候,下划线总是填写多少字就延长多少,文字前后加上空格 (这样线是变长的)是因为他用了文字下划线法;二、制作方法先将文字信息罗列出来统一调整字符宽度按照最长的字符长度-4个字符选中一列->选择类似A标志(如下图)->调整宽度->新文字宽度(4字符)全部选中->插入->表格->文本转换成表格->确定在表格的右侧插入一列单元格调整一下宽度->选中整个表格->边框中单原创 2022-05-20 09:50:50 · 2024 阅读 · 0 评论 -
Python代码-Python方法查询
1.关于__call__, __init__,forward详细参考:https://blog.youkuaiyun.com/hufei_neo/article/details/100153336参考:https://www.cnblogs.com/Guang-Jun/p/14496689.html参考:https://blog.youkuaiyun.com/weixin_41912543/article/details/108147378#:~:text=forward%E6%98%AF%E5%9C%A8__call__%原创 2022-05-19 11:54:56 · 2125 阅读 · 0 评论 -
在PyTorch中,forward()是如何被调用的?了解 __call__, __init__,forward,super()
文章目录`forward()`是怎么被调用的一、问题描述小Tip-段首缩进实现方法1.正常的`Python类`的执行顺序2.在神经网络中的应用参考一段代码:总结:接下来我们看几个例子,了解一下__call__, __init__,forward总结:参考链接forward()是怎么被调用的一、问题描述 看了一个源码,从最开始看到最后就看到了每个函数里面都有一个def forward()方法。但是,没有看到调用的地方,甚至是参数,和方法的参数都不一样了。 那代码怎么看呐?从网上看了好多的方法,总是原创 2022-05-17 21:50:52 · 2645 阅读 · 4 评论 -
为MobaXterm终端配一个自己喜欢的主题和背景颜色
软件描述MobaXterm是一款增强型远程连接工具,它向Windows桌面提供所有重要的远程网络工具(SSH,X11,RDP,VNC,FTP,MOSH等)和Unix命令(bash,ls,cat,sed,grep,awk,rsync等),可直接使用。MobaXterm 是一款远程控制工具,支持创建SSH,Telnet,Rsh,Xdmc,RDP,VNC,FTP,SFTP,串口(Serial COM),本地Shell,Mosh,Aws,WSL(微软子系统)等超多连接功能。MobaXterm 提供了人性化的操作原创 2022-05-03 11:27:14 · 33859 阅读 · 2 评论 -
论文公式以及公式标号怎么通过统一格式(居中、居右)
情况描述在word中添加公式以及序号,论文公式一般是下面的样式(通过MathType编辑后,在后面加上公式序号),不是我们想要的样式(公式居中+公式标号居右)平时都是需要不断地空格键来补全有点太麻烦了,本篇即有一个设置统一格式的方法来解决这个问题方法描述在word中,开始->创建样式...原创 2022-04-28 21:16:13 · 16279 阅读 · 3 评论 -
RuntimeError: Providing a bool or integral fill value without setting the optional `dtype` or `out`
一、问题描述报错提示:RuntimeError: Providing a bool or integral fill value without setting the optional `dtype` or `out` arguments is currently unsupported. In PyTorch 1.7, when `dtype` and `out` are not set a bool fill value will return a tensor of torch.bool dty原创 2022-04-23 11:32:30 · 2415 阅读 · 4 评论 -
ModuleNotFoundError: No module named ‘tensorboard‘
ModuleNotFoundError: No module named 'tensorboard'一、报错情况描述Traceback (most recent call last): File "main.py", line 5, in <module> from train import run File "**运行脚本路径**/spherenet_code/train.py", line 9, in <module> from torch.utils原创 2022-04-19 11:31:48 · 34535 阅读 · 5 评论 -
查看nvidia显卡GPU信息
一、介绍GPU的名称,温度,显存利用情况和GPU利用率,还有正在工作的GPU进程,如果我们知道这些信息,就足够我们对GPU的状态进行监控。主要是针对windows系统和linux系统的情况二、方法linux系统可以直接使用命令nvidia-smi,在任意界面都是可以的。windows系统方法/步骤:按 Win + R 组合键,打开运行,并输入:cmd 命令,确定或回车,可以快速打开命令提示符;管理员命令提示符窗口中,输入并回车执行以下命令:cd C:\Program File原创 2022-04-18 20:27:05 · 5382 阅读 · 0 评论 -
torch-geometric安装教程及常见源下载报错问题
安装torch-geometric一、介绍需要提前安装:torch-scatter、torch-sparse、torch-cluster、torch-spline-conv安装的时候会遇到很多的问题,版本号以及安装包源的问题安装框架模型,大约装了几个之后,每次给的教程都是会报错,就像是中了魔咒一样。其实最开始就感觉,安装东西还是要根据官方网站来解决这些问题。所以我们就参考当时的官方网站的安装教程。官方安装教程二、教程我们在官方教程里面主要是看Installation via Pip W原创 2022-04-17 21:53:49 · 4930 阅读 · 2 评论 -
使用Typora遇到的问题
前言Markdown是一种极为简洁的标记语言,使用简洁的语法代替排版,让我们能够专注于文字.Markdown的语法简洁明了、易于学习,而且功能比纯文本强,格式转换方便,能够轻松的导出为HTML、PDF等等格式文件。Typora是一款免费的轻量级Markdown编辑器,它用创新完全颠覆了这种传统的交互模式,它只使用一个窗口,却能优雅地实现同时将代码编辑与预览「一体化」结合起来!从而为用户带来更加流畅直观的「所见即所得的 Markdown 写作体验」。极简的 Typora 没有任何多余的功能,纯粹却仍原创 2022-04-14 14:55:51 · 4351 阅读 · 0 评论 -
MobaXterm简单实用方法-通过SSH连接服务器
登录SSH远程服务器一、配置用户信息1、打开Session2、打开SSH3、新建用户4、创建用户二、配置登录SSH服务器信息三、再次登录服务器一、配置用户信息1、打开Session2、打开SSH3、新建用户4、创建用户输入账号和密码,点击OK确认保存确认二、配置登录SSH服务器信息成功登录上三、再次登录服务器双击用户即可登录...原创 2022-04-12 21:27:33 · 18339 阅读 · 6 评论 -
Deepl使用教程
一、前言相信绝大多数科研人员都听说过DeepL的鼎鼎大名,美国TechCrunch给的评价是这样子的:“Tech giants Google, Microsoft and Facebook are all applying the lessons of machine learning to translation, but a small company called DeepL has outdone them all and raised the bar for the field. Its t原创 2022-04-11 11:09:57 · 69577 阅读 · 49 评论 -
Origin Pro2022教育版官方申请、安装及汉化、续期
OriginLab官网简介绝大多数学生都使用过Origin来绘图,并将这些图作为自己设计报告或者论文中的重要组成部分,这一点也是源于Origin在数据显示专业性。教育版有一些限制,比如序列号仅6个月有效期,窗口限制12个(窗口限制表示Origin项目中可访问的窗口数,包括所有类型的窗口-WorkBook,Matrix,Graph,Notes,Layout等总共限制为12个)。但是6个月后可重复文章步骤重新申请新的序列号与激活码(可以使用相同邮箱),且12个窗口可以在多数情况下能够满足需要。原创 2022-04-10 10:17:40 · 67908 阅读 · 23 评论 -
在word中快速得到数学公式
动机对于大多数的数学公式来说是特别复杂,而且特别的耗时,加上公式不能直接复制、粘贴,怎么样可以快速得到一个公式呐?关于有些无法复制的文字我们可以使用天若,也可以使用QQ截图识别文字,那么公式是不是也可以呐?所需内容识别公式的网站:在线LaTeX公式编辑器mathtype:这个就有好多中方法word:这个都要有的吧,以为就是想在word中写公式嘛注意安装mathtype的时候,要把office全家桶都关闭!!!不然装不上安装完成后,Office应该不会出现加载项,以下为解决办法原创 2022-04-04 16:12:26 · 3074 阅读 · 0 评论 -
Typora怎么将文本居中
前言Markdown是一种极为简洁的标记语言,使用简洁的语法代替排版,让我们能够专注于文字.Markdown的语法简洁明了、易于学习,而且功能比纯文本强,格式转换方便,能够轻松的导出为HTML、PDF等等格式文件。Typora是一款免费的轻量级Markdown编辑器,它用创新完全颠覆了这种传统的交互模式,它只使用一个窗口,却能优雅地实现同时将代码编辑与预览「一体化」结合起来!从而为用户带来更加流畅直观的「所见即所得的 Markdown 写作体验」。极简的 Typora 没有任何多余的功能,纯粹却仍原创 2022-04-03 17:03:44 · 11494 阅读 · 3 评论 -
shell脚本小知识一
需求:想要修改文章的从第m行到第n行的某一列的内容样例:一个小分子的内容1a30_ligandCreated by X-TOOL on Fri Sep 26 17:34:14 2014 49 48 0 0 0 0 0 0 0 0999 V2000 4.8410 27.5760 5.3100 N 0 3 0 4 0 4 5.7330 26.3940 5.1650 C 0 0 0 2 0 4 7.1740 26.7原创 2022-02-28 17:11:11 · 250 阅读 · 0 评论 -
读取一个.txt文件,随机读取几行,将剩下的数据和读取的数据分别在写入到两个新的文件
时间紧急,需要先保存一下;代码:import randomdef write_to_txt(file, start, end): #https://blog.youkuaiyun.com/weixin_37988176/article/details/109421798 with open(file, 'w') as name: for i in data[start:end]: #https://blog.youkuaiyun.com/cunjiu9486/arti原创 2021-09-29 11:11:09 · 283 阅读 · 0 评论 -
R语言知识小总结
1. read.table()read.table(file, header = FALSE, sep = "", quote = "\"'", dec = ".", numerals = c("allow.loss", "warn.loss", "no.loss"), row.names, col.names, as.is = !stringsAsFactors, na.strings = "NA", colClasses = NA, n原创 2021-09-08 15:37:47 · 5716 阅读 · 0 评论 -
综述
一,大致过程:1.知道自己的方向在哪, 查找国内外相关文献进行阅读, 积累相关的经验和知识2.考察所选的课题是否具有可行性3.其次明确自己的整体的科研流程, 收集和积累最近3-5 年国际上影响较高的杂志的一些研究成果, 进行总结和规整, 开始综述的构思4.最后从所阅读的大量文献中总结出与自己所选课题息息相关的一些成果, 进行综述的写作在文献阅读时有些英文文献可以根据其摘要所述内容进行初筛。综述并不是很多文献的堆积,而是对现有一些研究的归纳总结,和个人的一些看法。...原创 2021-05-07 20:53:46 · 829 阅读 · 0 评论 -
shell小知识总结
1.查找当前路径下的文件夹个数ls -l|wc -l2.遍历文件夹下的文件或文件夹#这样得到的是文件的内容(原理基本上差不多)path=`cat ${csvpath}`for locations in $pathdo echo $locationsdone#这样得到的是当前路径下的文件夹的名字for file in `ls $locations`do echo $filedone其实这些还有其他写法:知道就可以了。#这样得到的是文件的内容(原理基本上差不多)path=$原创 2021-01-30 20:08:03 · 2362 阅读 · 0 评论 -
shell语言学习
第一章:shell语言概述第二章:shell解析器第三章:shell脚本入门原创 2020-12-28 16:45:43 · 254 阅读 · 0 评论 -
linux学习
1.简介2.linux安装》添加一个自己当时安装的时候教程吧!《3.linux关机在linux领域内大多用在服务器上,很少遇到关机的操作。毕竟服务器上跑一个服务是永无止境的,除非特殊情况下,不得已才会关机。正确的关机流程为:sync > shutdown > reboot > halt关机指令为:shutdown ,你可以man shutdown 来看一下帮助文档。例如你可以运行如下命令关机:sync 将数据由内存同步到硬盘中。shutdown 关机指令,你可原创 2020-12-26 23:01:25 · 158 阅读 · 0 评论 -
学术论文搜索相关的网址推荐
这些都是从开始自己从网上找的或者同学老师推荐的国内就可以直接访问的百度学术链接中国知网国外的一些链接github链接谷歌学术链接X-mol链接Sci-hub链接-有时会失效(推荐谷歌插件-Sci-hub Now!)Web of Science链接-也没搜到过,不知道这是干啥的这是集合好多搜索网站前站导航虫部落-学术搜索一些其他的小网站在线语法检测鸠摩搜书学习网课...原创 2020-10-27 20:17:08 · 783 阅读 · 0 评论 -
吴恩达-机器学习笔记(单变量线性回归)
一,线性回归模型表示我们的第一个学习算法是线性回归算法。在这段视频中,你会看到这个算法的概况,更重要的是你将会了解监督学习过程完整的流程。让我们通过一个例子来开始:这个例子是预测住房价格的,我们要使用一个数据集,数据集包含俄勒冈州波特兰市的住房价格。在这里,我要根据不同房屋尺寸所售出的价格,画出我的数据集。比方说,如果你朋友的房子是1250平方尺大小,你要告诉他们这房子能卖多少钱。那么,你可以做的一件事就是构建一个模型,也许是条直线,从这个数据模型上来看,也许你可以告诉你的朋友,他能以大约22000原创 2020-10-21 15:23:00 · 292 阅读 · 0 评论 -
吴恩达-机器学习笔记(监督学习+无监督学习)
1.3 监督学习在这段视频中,我要定义可能是最常见一种机器学习问题:那就是监督学习。我将在后面正式定义监督学习。我们用一个例子介绍什么是监督学习把正式的定义放在后面介绍。假如说你想预测房价。前阵子,一个学生从波特兰俄勒冈州的研究所收集了一些房价的数据。你把这些数据画出来,看起来是这个样子:横轴表示房子的面积,单位是平方英尺,纵轴表示房价,单位是千美元。那基于这组数据,假如你有一个朋友,他有一套750平方英尺房子,现在他希望把房子卖掉,他想知道这房子能卖多少钱。那么关于这个问题,机器学习算法将会怎么帮原创 2020-10-15 18:50:26 · 369 阅读 · 0 评论 -
吴恩达-机器学习笔记(概念)
1.2.原创 2020-10-15 13:02:34 · 120 阅读 · 0 评论 -
Python学习-总结贴
Python学习<这里面的有点多,就没有摘出来,列一下标题便于看即可了。1.搭建环境2.安装开发环境—安装软件pycharm3.报错1:“no python interpreter configured for the project”4.报错2:弹出 Edit configuration窗口问题5.一个小技巧:添加到每个python文件的模板(每次文件,前边都会出现你想看到的字)Python学习一6.一个小技巧:debug调试步骤,在后面也有开发环境调试pyt..原创 2020-10-14 20:19:36 · 140 阅读 · 2 评论 -
Python学习-13(学生管理系统)
最后一站:1.2.3.4.#主函数def main(): while True: menm() #菜单栏函数 choice = int(input('请选择:')) if choice in [0,1,2,3,4,5,6,7]: if choice == 0: #退出 answer = input('您确定退出系统吗?y/n') if a原创 2020-10-14 19:28:26 · 1089 阅读 · 2 评论 -
Python学习-12(文件+os模块+with语句)
十五:1.python编码格式默认是UTF-8,文本文件默认是gbk不过最前面可以设置转换;编码格式不同,占据磁盘的大小不一样。2.例:readlines读到的存到了列表中:a.txt结果:3.二进制:3.原创 2020-10-08 10:13:30 · 188 阅读 · 0 评论 -
Python学习-11(模块+包+第三方模块的安装)
十四:1.模块中包含函数包含类包含语句类种包含类属性,实例方法,类方法,静态方法,实例属性2.导入模块:(导入模块的所有+导入模块的指定部分)结果:这两个pow的位置不一样导入自定义的模块进行使用:自定义的模块:calc直接在目录下,单击右键3.calc2:如果没有写if判断的话,会两个都会输出;3.介绍包:先是建了一个包,里面有三个模块;module_A:module_B:4.爬虫使用:5.在线安装:–cmd就这原创 2020-10-06 15:26:42 · 183 阅读 · 0 评论