光谱转移与变换:去除土壤水分等外部影响
1. 光谱校正与土壤水分影响
在光谱分析中,不同仪器获取的光谱可能存在差异,需要进行校正。同时,土壤的红外光谱对外部环境条件(如土壤水分)非常敏感。土壤的吸光度光谱会随着水分含量的增加而增大。在实验室中,土壤通常在标准风干条件下进行扫描,但在野外很难控制土壤的含水量。尽管许多研究成功地使用野外采集的光谱来校准土壤性质(如土壤有机碳,SOC),但土壤水分含量的变化确实会对土壤性质的预测产生重要影响。
1.1 光谱校正示例
这里展示了参考仪器的光谱和通过分段直接标准化(PDS)校正后的从属仪器光谱。需要注意的是,由于对光谱应用了移动窗口操作,应去除光谱的边缘部分。
1.2 土壤水分对光谱的影响
为了研究土壤水分含量对光谱的影响,我们使用了包含 100 个土壤样本(来自更大数据集的子集)在 3 种不同水分条件下的光谱数据:
- spectra0 :土壤在风干条件下的吸光度光谱(平均水分 5%)。
- spectra1 :土壤湿润后的吸光度光谱(平均水分 12%)。
- spectra2 :湿润土壤风干 1 天后的吸光度光谱(平均水分 9%)。
以下是加载和处理数据的代码:
# load the required packages
require(prospectr)
require(soilspec)
# load the package data
data("dat