DNA比对---蓝桥杯练习

DP大法好！

题目描述

脱氧核糖核酸即常说的 DNA，是一类带有遗传信息的生物大分子。它由 4 种主要的脱氧核苷酸( dAMP、dGMP、dCMT 和 dTMP )通过磷酸二酯键连接而成。这 4 种核苷酸可以分别记为：A、G、C、T。

DNA 携带的遗传信息可以用形如：AGGTCGACTCCA······ 的串来表示。DNA 在转录复制的过程中可能会发生随机的偏差，这才最终造就了生物的多样性。

为了简化问题，我们假设，DNA 在复制的时候可能出现的偏差是（理论上，对每个碱基被复制时，都可能出现偏差）：

漏掉某个脱氧核苷酸。例如把 AGGT 复制成为：AGT

错码，例如把 AGGT 复制成了：AGCT

重码，例如把 AGGT 复制成了：AAGGT

如果某 DNA 串 aa，最少要经过 nn 次出错，才能变为 DNA 串 bb，则称这两个 DNA 串的距离为 nn。

例如：AGGTCATATTCC 与 CGGTCATATTC 的距离为 2。

你的任务是：编写程序，找到两个 DNA 串的距离。

输入描述
用户先输入整数 (n<100)，表示接下来有 2n 行数据。

接下来输入的 2n 行每 2 行表示一组要比对的 DNA。（每行数据长度< 10^4）

输出描述
程序则输出 n 行，表示这 n 组 DNA 的距离。

输入输出样例
输入

	3
	AGCTAAGGCCTT
	AGCTAAGGCCT
	AGCTAAGGCCTT
	AGGCTAAGGCCTT
	AGCTAAGGCCTT
	AGCTTAAGGCTT

输出

	1
	1
	2

思路

设置一个二维数组dp，使用dp[i][j]表示转录字符串str2[0:j]与目标字符串str1[0:i]的距离，两个字符串中元素对比时会出现四种情况

1、正确

dp[i][j]=dp[i-1][j-1]

2、错误

dp[i][j]=dp[i-1][j-1]+1

3、缺失

dp[i][j]=dp[i][j-1]+1

4、重复

dp[i][j]=dp[i-1][j]+1

求的是最优解所以当str1[i-1] 和 str2[j-1] 不等时，dp[i][j]=min(dp[i-1][j-1]+1,dp[i-1][j-1]+1,dp[i][j-1]+1)

代码

import os
import sys

# 请在此输入您的代码
n=int(input()