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原创 AI逻辑+生信代码=报错消失!一次跑通的爽感谁懂‼️
摘要:医学生信项目中最痛苦的不是代码本身,而是难以理解的报错信息。通过与AI进行深度对话,转变思维模式——不再死磕代码细节,而是重点理解分析逻辑和流程。AI不仅能解释报错本质(如数据标准化顺序错误),还能提供完整修复方案,将3天的调试时间缩短至20分钟。生信分析的核心在于掌握思维方式而非代码编写,AI成为理清逻辑、查漏补缺的理想"清醒搭子"。
2025-12-26 12:03:55
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原创 科研必备神器!Metascape基因分析,1秒出报告,省时又高效!
富集分析通过比对输入基因列表与已知基因集,揭示潜在的生物学意义。Metascape创新性地采用层次聚类方法,计算富集术语间的相似度,将相关性高的术语自动归类,从而提供更精炼的分析结果。注:每个点代表一个条目,每种颜色代表一个簇的ID/p-value。这里Metascape对富集条目进行聚类,相似度大于0.3的通过边连接,为清楚起见,每个簇仅显示一个术语的术语标签。该富集分析结果条形图以-log10(P)为横轴,富集条目ID和名称为纵轴展示,并通过颜色深浅直观地反映p值大小(p值越小,颜色越深)。
2025-02-06 09:11:38
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原创 GseaVis | GSEA富集分析可视化利器
这是一个GSEA富集分析可视化R包的介绍文章,详细说明了GseaVis包的安装使用方法、可视化功能以及结果解读,并提供了实用的代码示例。
2025-01-16 12:18:16
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原创 TCGA数据分析避坑指南 - 资深生信人的经验总结
TCGA数据库作为癌症研究的核心数据来源,提供了大量的多维度癌症数据,支持从基因组学、转录组学到临床数据的全面分析。通过TCGA数据库,研究人员能够有效地进行差异表达分析、预后分析以及其他癌症相关的生物学研究。致力于现学现用,打破无效的R数据分析学习模式:通过实践导向的教学方法,帮助学员迅速掌握R语言在生物信息学中的应用。致力于掌握学习方法,在实战中进行演练,提升思维逻辑和解决实际分析问题的能力:通过真实案例的分析,培养学员的独立思考和问题解决能力。价格实惠,内容到位。
2025-01-07 12:03:31
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原创 生物信息分析必备 | GSEA富集分析一文通透
这是一篇关于GSEA(基因集富集分析)的详细教程。文章介绍了富集分析的基本概念、常用数据库(KEGG、GO、Reactome等)、分析原理和步骤,并提供了完整的R代码实例,帮助读者理解和实践GSEA分析。
2025-01-07 11:48:27
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原创 科研艺术:用火山图点亮差异基因可视化之美
在这篇文章中主要以“火山图”为主题,向读者展示了差异基因可视化的独特魅力。通过生动的语言和精美的图例,强调可视化的创新潜力。利用R语言的示例代码,详细讲解了如何制作火山图,并解析了图中不同颜色点的生物学意义。
2025-01-02 17:53:29
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原创 差异分析王者之战: DESeq vs Limma vs edgeR
本文介绍了基因差异表达分析的基本概念和重要性,重点讲解了使用DESeq2进行RNA-seq差异分析的完整流程。涵盖了数据预处理、分组设计、统计检验、多重假设校正及结果可视化等关键步骤。对比了DESeq2、edgeR和limma三大主流差异分析工具的特点及适用场景,并提供了实际代码示例,便于读者上手操作。差异基因分析作为生信研究的核心技术,对肿瘤微环境、自噬等研究方向具有重要推动作用。
2024-12-27 16:57:52
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原创 wordcloud安装出错方法
直接输入pip install wordcloud,发现出错,说error: Microsoft Visual C++ 14.0 or greater is required. Get it with "Microsoft C++ Build Tools": https://visualstudio.microsoft.com/visual-cpp-build-tools/然后要打开https://visualstudio.microsoft.com/visual-cpp-build-tools/,出现这.
2021-07-05 22:14:15
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空空如也
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