AlphaFold-multimer 复合物结构预测

VIPAlphaFold-multimer 复合物结构预测
是DeepMind开发的AlphaFold项目的一个扩展,旨在预测蛋白质多聚体的三维结构。蛋白质多聚体是由多个蛋白质亚单位相互组装而成的结构,如酶、膜蛋白复合物和病毒颗粒。理解多聚体的结构对于揭示蛋白质的功能和相互作用非常重要。
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AlphaFold-multimer 复合物结构预测

AlphaFold-multimer是DeepMind开发的AlphaFold项目的一个扩展,旨在预测蛋白质多聚体的三维结构。蛋白质多聚体是由多个蛋白质亚单位相互组装而成的结构,如酶、膜蛋白复合物和病毒颗粒。理解多聚体的结构对于揭示蛋白质的功能和相互作用非常重要。

在这里插入图片描述
写在前面:不建议在个人电脑上安装AlphaFold,因为对算力的存储的要求较高,个人电脑的配置而言稍显吃力。建议尝试AlphaFold Colab。

docker容器查看

docker  images       #列出以安装的容器
docker ps            #正在运行的容器

激活conda的base环境

VIP Alphafold2/multimer本地安装+报错处理 Alphafold2本地部署常见的有两种方式:一、构建Docker镜像;二、Conda部署。尝试了一下第一种方法碰到了无法运行(不报错,但不执行计算)的问题,加上对Docker不熟悉,所以放弃,转而选择第二种。安装硬件设备:CPU: 64核磁盘: 4T系统: Ubuntu18.04RAM: 64G显卡:NVIDIA GV102CUDA版本: 11.7显卡驱动版本:515.43.04。 开通可读全文·4k 阅读·3 点赞·13 收藏 阅读全文

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MurphyStar
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