到目前为止，我在整个博士期间学到的 10 课
读博士两年过去了，最近我一直在反思我所学到的东西。这是一个有许多起伏的过山车。有许多不眠之夜，令人沮丧的时刻，当然还有许多学习经历。
在这篇文章中，我想与大家分享我在过去 2 年中作为数据科学相关领域的一名研究生学到的 10 课。如果你打算开始学术生涯或者你已经开始了，我希望这 10 节课对你有用。让我们开始吧。
1. 以批判性思维方式研究文献
重要的是不要停止提问。
- 艾尔伯特爱因斯坦
您所在领域的相关工作包含您需要了解的所有知识。如果您是研究和搜索主题的新手，最好的地方是您所在领域的现有工作。但是，请记住在阅读他人的作品时要保持开放的心态。不要盲目相信一切，总是问问题。想想如果你要解决这个问题你会怎么做，以及你选择方法背后的原因。
自攻读博士学位以来，我一直在使用各种工具来对不同的数据集进行基准测试。我遇到过无法重现某些工具出版物中声称的结果的情况。有时当我联系作者时，一个常见的回答是他们不知道，或者是沉默的对待。这是当前研究界的可悲事实。许多人牺牲了研究质量而不是数量。
我并不是说每件作品都会受到损害。也有出色的作品，我尽我所能将它们作为坚实的基础。
2.总是讲一个故事来表达你的问题
讲故事是将想法付诸实践的最有力方式。
— 罗伯特·麦基
该图片由Tumisu在Pixabay上发布
在计算机科学和生物学相遇的生物信息学等跨学科领域，你需要一个故事来解释你在做什么。并非所有生物学家都是计算机科学家，也并非所有计算机科学家都是生物学家。
在我攻读博士学位的早期，当有人问我的研究课题时，我会用所有的技术术语解释，最后把他们弄糊涂了。这让我重新思考了我的解释方法。我怎样才能让别人用简单的语言理解我的复杂主题？
后来，我想出了如何用一种简单易懂的方式来解释我的研究课题。我总是会尝试在现实世界中编造一个与我的问题相关的故事。这使得它很容易解释，以便任何人都可以理解。
3. 定义你的范围
你能做任何事但不可能凡事必做。
— 大卫艾伦
照片由Paul Skorupskas在Unsplash上拍摄
研究领域是一个广阔的领域，可以有许多主题需要研究。即使是这些单独的主题，您也可以探索不同的方向。您必须选择一个主题，确定您要做什么并定义范围。如果你试图做任何事情，那么你将无法完成任何事情。因此，始终明确定义您将要做什么的范围。如果您卡在当前范围内，那么您可以扩大一点，看看还有什么可能。
4. 将您的问题与现有解决方案联系起来
研究就是看别人看到了什么，思考别人没有想到的。
— Albert Szent-Gyorgyi
大多数研究问题很可能是在过去几十年中有人遇到的。可能已经提出了类似的方法来解决您打算解决的问题。如果你像我一样做跨学科研究，那么你可以通过借鉴现有工作的想法来模拟你的问题。尽管还没有人提出这样的模型，但基础确实存在。您所要做的就是将知识应用到您的场景中并继续搜索，直到您可以推断出解决方案，或者最终证明不存在解决方案！
5.在现实世界中你无法避免脏数据
数据就像垃圾一样。在你收集它之前，你最好知道你将如何处理它。
— 马克吐温
您需要根据要解决的研究问题获取数据。由于我的研究问题与基因组研究有关，因此我需要拥有包含基因组数据的数据集。
模拟数据集使事情变得更容易，因为您可以轻松获得基本事实。但是，当您使用真实数据时，很难确定确切的基本事实。此外，真实数据中存在很多噪音和模糊性，您提出的解决方案可能无法完美运行，因为它们适用于模拟数据。您可能必须做出某些假设并继续您的工作。在处理真实数据时，总是有一个边界，你必须停下来，因为超出这个边界，没有人知道什么是正确的。
6. 尽可能清楚地展示您的解决方案
清晰和简单是复杂性和不确定性的解毒剂。
——乔治·凯西将军
该图片由janjf93在Pixabay上发布
一旦您想出了解决问题的解决方案，您就必须将其呈现给社区。我们做的最常见的事情是编写一篇文章并将其提交给会议或期刊。您必须清楚地解释您的方法，而不会造成任何混淆。在介绍您的方法时，写作风格很重要。
在提出解决方案时，强烈建议使用视觉提示。例如，您可以使用流程图逐步解释您的方法。您还可以举一个简单的示例，并解释示例的状态在方法的每个步骤中是如何变化的。此外，您可以使用图表和图表来解释结果的显着改进。
7.拒绝是正常的
成功埋藏在拒绝的另一边。
— 托尼·罗宾斯
完成文章后，您可以将其提交给会议或期刊。始终鼓励针对某个领域的顶级会议和顶级期刊。每年，这些会议和期刊都会收到很多高质量的作品，审稿人会选择少数几篇发表。这实际上取决于您的作品展示的质量（以及您的运气）。你越能给审稿人留下深刻印象，你的作品被接受的机会就越大。
第一次提交时，您的作品可能不会被接受。我攻读博士学位的第一份工作被会议拒绝了。做研究时被拒绝是很正常的。不要将其视为失败。将其视为改进解决方案的新机会。即使你的作品被拒绝，审稿人也会提供他们的意见。这些评论通常包含
- 您在评估中遗漏的要点
- 您的方法中不清楚的领域
- 对您可以测试的更多工具、方法和数据集的建议
- 您的方法的可能扩展
您可以使用这些评论来改进您的工作。我能够根据审稿人的意见改进我被拒绝的文章，并将其发表在我所在领域的顶级期刊之一上。关键是当你的工作被拒绝时永远不要放弃。
8. 你必须获得和发展技能
一个人必须培养能够扩展能力的技能，使一种能力比现在的能力更重要。
— 米哈利·契克森米哈伊
研究人员是问题解决者。要解决问题，您需要同时具备技术技能和软技能。
您需要编程和统计等技术技能来解决您感兴趣的问题并提出可靠的解决方案。随着目前开源软件的日益普及，如果你制作了一个包含你提出的方法的自动化工具，它更有可能受到研究界的赞赏，因为任何人都可以使用它并重用你的代码。此外，您必须使用基于统计数据的适当评估指标来分析您的结果。
您需要诸如口语和写作之类的软技能来展示您的解决方案。想象一下，您必须向您的小组展示您提出的方法。你需要想出一个清晰的故事并清楚地展示你的方法。同样，当您编写要发表的手稿时，清晰和简单也适用。
9. 在你的领域保持最新
日复一日，几乎一分一秒地更新过去。
——乔治·奥威尔
每个领域都在进步，每天都有新事物出现。提出了改进和有效的方法来解决已经解决的问题。您必须及时了解您所在领域的新发展。您可以从这些新发展中汲取灵感并在您的工作中使用。
了解最新进展的一个好方法是阅读在顶级期刊和顶级会议上发表的新研究文章。这些高质量的工作可以为您的工作提供有价值的见解。我总是使用Google Scholar寻找新的出版物，我也加入了ResearchGate。
10. 与您所在领域的专家建立联系
您的网络就是您的净资产。
— 波特·盖尔
伊万杰琳·肖 ( Evangeline Shaw ) 在Unsplash上拍摄的照片
会议和专题讨论会是您可以与您所在地区的专家会面并了解他们工作的一些主要场所。您可以通过认识人来扩展您的网络。通常，人们正在寻找候选人以招募到他们的实验室或与之合作。如果您在完成博士学位后对研究实习或博士后机会感兴趣，那么在您的网络中建立这些联系将是有益的。
最后的想法
总结这篇文章，这里是关键要点。
- 批判性地分析
- 讲一个故事
- 明确定义您的范围
- 与现有工作相关
- 处理真实世界的数据
- 专注于简单和清晰
- 不要对拒绝感到失望
- 发展新技能
- 跟上新的发展
- 发展你的网络
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