1.打开shell命令行输入sudo apt-get install r-base命令安装R
2.安装RStudio服务器:打开shell命令行,依次输入以下命令并执行
sudo apt-get install gdebi-core
WGET https://download2.rstudio.org/server/jammy/amd64/rstudio-server-2023.06.2-561-amd64.deb
sudo gdebi rstudio-server-2023.06.2-561-amd64.deb
成功测试:shell命令行中输入:rstudio-server status即可查看rstudio的状态。
3.进行R相关包的安装:打开shell命令行,输入R进入R语言环境后输入以下命令。
install.packages(“ggplot2”)
install.packages(“BiocManager”)
BiocManager::install(“SingleCellExperiment”)
BiocManager::install(“scater”)
成功测试:>library(包名)不报错即成功。
4.可能报错:
安装SingleCellExperiment出现Rcurl包安装出错
解决方案:使用 install.packages(“RCurl”)安装出现cannot find curl-config—》q()退出R,在Terminal下使用命令sudo apt-get install libcurl4-openssl-dev安装(如果出现软件⽆法定位先更新⼀下:sudo apt-get update)—》再“R”进⼊R后安装SingleCellExperiment。
缺少libssl1.0.0|libssl1.0.2|li