PyRadiomics中提取特征的配置文件设置

在PyRadiomics中提取"Original"的entropy特征，需要在配置文件yaml文件中指定特征提取方式和要提取的特征，配置文件yaml文件应该如下：

 

imageType: Original

featureClass: shape,firstorder,glcm,glrlm,glszm,ngtdm,gldm

omitSymmetry: true

normalize: true

interpolator: sitkBSpline

enableCExtensions: true

binWidth: 25

sigma: 1.0

enableLogging: false

enableImageTypes: false

 

shape:

  enabled: true

 

firstorder:

  enabled: true

  features: ['Entropy']

 

glcm:

  enabled: true

  symmetric: true

  distance: [1]

  angles: [0, 45, 90, 135]

  features: ['Entropy']

 

glrlm:

  enabled: true

  distance: [1]

  angles: [0, 45, 90, 135]

  features: ['Entropy']

 

glszm:

  enabled: true

  bins: 64

  features: ['Entropy']

 

ngtdm:

  enabled: true

  distance: [1]

  features: ['Entropy']

 

gldm:

  enabled: true

  features: ['Entropy']

在上面的配置文件中，我们指定了要提取的特征类别，包括shape、firstorder、glcm、glrlm、glszm、ngtdm和gldm，然后在每个特征类别下面指定要提取的特征，如在firstorder下面指定了要提取的Entropy特征。同时，我们也指定了要提取的图像类型为Original，并且将normalize设置为true以进行归一化处理。最后，我们将enableLogging设置为false以关闭日志记录，将enableImageTypes设置为false以禁止使用所有图像类型，只使用指定的图像类型。