本文参考的是B站UP主啦啦黑还黑的视频内容,其中视频链接为:http:// https://b23.tv/ZIjXO6a,而作者主页为:http:// https://b23.tv/5FddCYP
1 MOF
首先是晶体结构数据库,例如这里使用MOF数据库,网站链接为:https://mof.tech.northwestern.edu/,页面如下所示:

例如这里选择tobmof-8258:

进入界面:

可以将cif文件下载下来:

这里效果如下所示:

MOF一般计算吸附性质,或者作为催化材料。还可以计算机吸附能。由于MOF和原子数比较大,所以经常会遇到一些情况就是SCF不收敛。
点击Modules选项卡中的Build选项卡,然后点击Symmetric,然后点击Find Symmetric,然后点击Find Symmetry:

经过查看可以看到Symmetry Group为C1-1类型的,不能进行简化。
2 分子筛
和MOF类型,分子筛也有自己的数据库,网站链接为:Database of Zeolite Structures

点击All Codes,这里选择MFI:

点击进去,然后查看右上角的CIF:

放到Materials Studio软件中:

这里实验就是在MIF分子筛模型中添加一个Mo原子,然后补充Mo原子里的O元素,然后进行后续实验。
这里首先去除对称性,点击Build选项栏中Symmetry选项栏中make P1,这里目的是去除晶体中的对称性。然后添加Mo原子,选择一个较大分子筛环中然后加Mo原子,加完Mo原子之后

然后点击Calculate Bonds中的Bond Options:

这里设置为1.312,点击Calculate:

将重要的几个原子用球棍模型表示,然后其他原子使用线性模型来表示。最终效果如下所示:

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