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RSS订阅原创 pycharm新建项目选择正确的解释器
记得终端中的路径需要修改为以下路径，不能是默认的。，不然可能切换不了自己创建的虚拟环境。打开设置，重新选择解释器。，重新打开刚刚创建的项目。文件夹中的刚刚新建的。
2024-09-06 14:46:04
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原创 蛋白组学分析资料
蛋白质组学MaxQuant 使用过程中踩的一些坑 linux版本组学数据分析实操系列 | （一）用MaxQuant软件对定量蛋白质组学数据进行数据库检索 包含TMT参数设置蛋白质组学质谱数据搜库分析 | MaxQuant软件的使用 以TMT数据为例
2024-08-30 08:38:45
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原创 单细胞数据分析问题（一）对多样本进行标准化&使用glmGamPoi包
包进行并行或异步计算时，你尝试导出的全局变量总大小超出了。当你的全局变量总大小超过这个限制时，就会触发这个错误。选项来增加允许的全局变量大小。例如，如果你想将其设置为。选项所允许的最大值。默认情况下，这个最大值被设置为。出现这个错误是因为在使用R语言的。为了解决这个问题，你可以通过调整。
2024-08-16 21:49:34
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原创 安装R&Rstudio&Rtool
包被下载后会默认将二进制zip文件保存在本地C盘的临时会话的downloaded_packages目录下，不希望保存在该目录下，想手动修改保存路径，通过。安装软件很简单，需要注意的就是安装的顺序，一定是。，安装的路径不要有中文，且安装在同一目录下；
2024-07-17 19:49:24
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原创 单细胞转录组学习流程&总结——（一）背景原理+软件安装+上游分析
由于这里作者上传的只有两边Read的fastq，不包含Index，因此只批量命名了两个Read文件名称，如果项目包含了index，可根据需求结合cellranger官方建议进行改写。将cellranger的路径加入$PATH，这样只需要在终端输入cellranger就可以执行命令。虽然安装完毕，但是现在要运行cellranger的话需要在终端输入cellranger的整个路径。终于知道是怎么回事了，是由于我已经临时加载环境变量，导致那些命令都不能用了，所以后面重新进入。重命名，脚本如下，命名为。
2024-07-03 17:32:03
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原创 猪_RNA_seq的Clean_data上游分析&下游分析总结
STAR昨天拿到了公司测序的转录组数据，已经进行了数据清洗，可以直接比对基因组，基因组文件和注释文件之前都已经下载过了，可以直接用，参考上篇推文。
2024-06-13 19:21:51
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原创 小鼠RNA_seq数据上游分析学习总结&流程
出现该界面，按回车出现这些内容就按键盘上的 q 键输入yes出现这个界面就按回车键，就会进入安装状态，可能需要一些时间输入yes，安装完成然后退出登录，重新进行登录登录以后再输入命令的地方最前面会多出一个(base)，这就说明安装好了如果我们想安装某个软件，可以首先用命令搜索一下这个软件在anaconda中是否存在比如转录组数据处理中经常用的比对软件hisat2conda有些软件安装不上，可能是因为用的命令不对例如，下载bowtie2conda。
2024-06-11 21:18:22
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原创 课题相关资料
蛋白质组学相关资料数据库BioPlex 经过实验验证的蛋白互作数据库文章An Introduction to Mass Spectrometry-Based ProteomicsUsing R for proteomics data analysisA beginner’s guide to mass spectrometry–based proteomicsProteomic analysis articles from across Nature PortfolioA prac
2024-06-06 21:13:37
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空空如也
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