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原创 Seruat5计算线粒体基因占比时出现全为0情况
在使用PercentageFeatureSet(seurat_obj, pattern = "^MT-")计算时,发现结果全为0,通过查找网上的文献发现都没办法解决,通过查找各种方法最终解决这一问题,下面是我的方法,遇到相同问题的小伙伴可以尝试下。中,作者也说明了主要是由于计算时无法找到线粒体基因,因此首先对基因进行重命名,然后会给出相应的名字(红框中的),将其放在pattern中对应位置上,计算即可得到线粒体占比。
2025-04-26 21:59:52
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