
生物信息学
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天威难测
NJUCM中药学专业中一个自学计算机的羽毛球爱好者
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【中药网络药理学】筛选细胞衰老和预后相关基因(附分类代码和画图代码)
通过TCGA-LIHC数据集(2023年1月,n=377),下载clinical(临床信息),点击Metadata(样本信息),cart(基因文件)[/data/TCGA数据库]获取转录组测序数据与临床数据,并排除了临床数据不完整的患者队列。首先使用生存分析中的Cox比例风险模型建立一个风险评分系统,然后利用风险评分中位数对其进行分组,将其分为“高风险组”和”低风险组“,并绘制生存分析图(针对筛选出的基因)接下来,基于拟合多因素Cox回归和lasso回归,构建预后效果评价分类模型。原创 2024-08-03 20:55:40 · 668 阅读 · 0 评论 -
【生信】R语言进行id转换的方法(附可直接使用代码)
利用R语言进行ncbi数据库的id转换,生信必会,附代码,可以直接使用,讲解gene assignment和gene symbol的关系原创 2023-01-05 19:08:02 · 7845 阅读 · 0 评论