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原创 【医学图像数据增强】

【代码】【医学图像数据增强】

2025-03-08 20:19:53 286

原创 【知识管理】白质高信号为什么用FLAIR诊断分割

白质高信号(White Matter Hyperintensities, WMH)在MRI上主要表现为T2加权像(T2WI)和FLAIR序列中的高信号,而在T1加权像(T1WI)中通常不敏感(呈等或略低信号)。,且病变成分可能产生信号抵消效应,WMH在T1WI中通常表现为等或略低信号,难以与正常白质区分。而T2WI和FLAIR对水分变化高度敏感,能清晰显示WMH的高信号,因此成为检测和分割WMH的主要序列。白质高信号(WMH)主要由水肿、脱髓鞘和胶质增生引起,这些病变导致组织水分增加和脂质减少。

2025-03-07 13:44:28 517

原创 【知识管理】fMRI ICA

对rsfMRI进行ICA分析,得到的是代表不同功能脑网络或噪声的独立成分。每个成分包含空间分布图(哪些脑区参与)和时间序列(网络活动动态)。通过分离这些成分,研究者可以揭示大脑自发活动的功能架构,并进一步分析其与行为、疾病的关联。对静息态功能磁共振成像(rsfMRI)进行独立成分分析(ICA)是一种常用的方法,用于研究大脑自发活动的功能网络。

2025-03-07 09:38:35 388

原创 batchNorm 和layernorm的区别

Batch Normalization (BN) 是一种在深度学习中常见的技术,它通过对每一批数据的特征进行归一化处理,使得每一层的输入数据分布趋于稳定,从而加速网络的收敛速度并提高模型的泛化能力。Layer Normalization (LN) 是另一种深度学习中的归一化技术,它对每个样本的所有特征进行归一化,主要用于处理同一样本内部特征之间的分布差异。

2024-07-01 10:02:45 538

原创 【遇到的问题】集群上查看gpu的使用情况

【代码】【遇到的问题】集群上查看gpu的使用情况。

2024-06-25 16:48:01 397

原创 【遇到的问题】slurm系统下查看都有哪些卡

【代码】【遇到的问题】slurm系统下查看都有哪些卡。

2024-06-25 11:05:37 228

原创 【知识管理】统计检验的方法χ²测试,双侧两样本t检验,Whitney–Mann U检验,单侧配对t检验(One-Sided Paired T-Test)

这段描述提到了几种统计检验方法,它们在MATLAB中的实现用于比较不同组之间的性别、年龄、教育背景和临床认知分数的差异,以及比较模型在内部验证中的性能。

2024-03-02 09:43:15 2637

原创 【知识管理】计算全局效率 Network global efficiency

这句话提到的“全局效率”(global efficiency)是网络中信息传递效率的一个衡量指标,它是网络中最短路径长度的倒数的平均值。

2024-03-01 20:41:31 1173

原创 【知识管理】计算模块性

这里的思路是基于网络保持相同的度分布的假设,即每个节点的连出边数(或度)在随机网络和原网络中是相同的。通过计算所有节点对(i,j)的这个差值,并乘以指示函数(\delta(c_i, c_j))来考虑只有当节点i和j在同一模块时这个差值才被累加,最后除以(2m)来标准化这个值,从而得到网络的模块性(Q)。因此,公式中的 (\frac{k_i k_j}{2m}) 是计算模块性时考虑随机性的关键,它帮助我们理解网络的连接模式是否真的比随机连接更有组织性,尤其是在模块或社区内部。

2024-03-01 20:33:07 487

原创 【知识管理】假设检验pvalue的计算

让我们通过一个具体的例子来解释P值的计算过程,假设我们有一个模型用于区分SCD(亚临床痴呆)和HC(健康对照)的分裂。我们通过置换测试来计算模型性能的P值。

2024-03-01 20:14:59 916

原创 【知识管理】fsLR surface,fsaverage,MNI152 volumetric 不同space

每种空间都适用于特定类型的数据处理和分析。选择哪种空间取决于研究的具体需求、所用的分析软件以及数据的来源。例如,表面空间特别适合于分析大脑皮层的数据,而体积空间适用于整个大脑的分析,包括皮层下结构。通过在适当的空间中分析数据,研究者可以更准确地解释大脑活动和结构的变化。在神经科学和脑成像研究中,不同的"space"(空间)表示用于分析和比较功能磁共振成像(fMRI)数据的不同标准脑模板或坐标系统。

2024-02-29 11:19:50 1187

原创 【知识管理】Lewy小体痴呆

看到不存在的东西,称为幻觉,可能是Lewy body dementia的第一个症状。Lewy body dementia的患者可能看到不存在的形状、动物或人。Lewy body dementia是一种逐渐恶化的疾病,随着症状的加重,可能会出现以下并发症: 严重的痴呆,好斗行为,抑郁,增加跌倒和受伤的风险,帕金森症状的恶化,如震颤,病情恶化后,平均7至8年后可能会导致死亡。这可能导致患者摔倒。有Lewy body dementia或帕金森病家族史的人患Lewy body dementia的风险更高。

2023-12-19 10:48:19 555

原创 【知识管理】切变换(Shearing)

切变是一种线性变换,它在仿射变换中描述了平行线之间的相对位移。切变可以沿坐标轴引入不同方向上的平移,从而改变图形的形状。在二维空间中,通常有两个方向的切变:水平切变(沿x轴的切变)和垂直切变(沿y轴的切变)。这种切变沿x轴方向引入平移,使图形的各点在y方向上产生相对位移。水平切变的效果是改变图形在水平方向上的形状。这种切变沿y轴方向引入平移,使图形的各点在x方向上产生相对位移。垂直切变的效果是改变图形在垂直方向上的形状。在三维空间中,也存在与xy平面、xz平面和yz平面上的切变,分别称为。

2023-12-19 10:47:42 1525

原创 【BME2112】w11 notes

下周做老鼠实验。

2023-12-06 19:45:19 457

原创 torch.unsqueeze(),torch.scatter_

【代码】torch.unsqueeze(),torch.scatter_

2023-12-04 16:18:56 404

原创 【picGp Github typora上传图片失败】

端口不匹配。

2023-12-04 16:13:07 444

原创 tar tar.gz

【代码】tar tar.gz。

2023-12-04 16:11:33 454

原创 【linux下配置环境变量】

linux下配置环境变量

2023-12-04 16:08:59 534

原创 切换虚拟环境,conda命令找不到

当前环境变量没有配置好。

2023-12-04 11:46:09 629

原创 【线性表】

线性表顺序存储线性表的顺序存储结构或顺序映像:用一组地址连续的存储单元存储线性表的数据元素(物理顺序与逻辑顺序一致)。是一种随机存取的存储结构(只要确定了其起始位置,表中任一数据元素可随机存取)。线性表:逻辑结构顺序表:存储结构1)顺序表的实现typedef struct{ char no[20]; char name[10]; float price;}book;typedef struct{ book *elem; int length;}..

2023-12-04 11:42:42 1103

原创 【cardiac gating】

这个过程通过监测心脏的电活动来工作,通常使用心电图(心电图)。成像设备然后在心脏周期的特定时间捕捉图像,通常在运动最少的时期,如舒张末期或收缩末期。通过这样做,心脏门控有助于产生更清晰,更详细的图像心脏和周围结构,这是至关重要的准确诊断和治疗计划。它包括同步成像过程与病人的心脏周期,以减少运动伪影。当成像区域靠近心脏,如胸部或心脏本身,这是特别重要的,在运动可以模糊图像和降低其质量。

2023-12-04 11:35:28 416

原创 【BCE】

Certainly!

2023-12-04 11:34:45 1622

原创 【Ref#008】human connectom

DMN是默认模式网络(Default Mode Network)的缩写,它是一个大脑网络,涉及许多内部指向的认知过程,如自传体记忆、内省、想象未来和考虑他人的观点。研究表明,DMN的活动可能与诸如阿尔茨海默病(老年痴呆症)等神经退行性疾病的发病机制有关。海马位于颞叶内侧、边缘叶深部,组成侧脑室颞角的底及内侧壁的双层灰质结构。Aβ最初在默认模式网络(DMN)的元素中积累,这些元素包括内侧额叶皮层和内侧顶叶皮层。随着疾病的发展,这种神经变性逐渐蔓延到颞叶和顶叶皮质,并最终蔓延到大部分皮质(从脑内部部往上走)。

2023-12-04 11:32:11 452

原创 【AV45, FDG, and PIB PET】

AV45, FDG, and PIB are three different types of tracers used in Positron Emission Tomography (PET) scans, each with a specific purpose in neurological and medical imaging:AV45 (Florbetapir): AV45, or Florbetapir, is a tracer used in PET scans to detect bet

2023-11-16 20:54:09 1479

原创 【Dtatset】ADNI table

实际上应该指的是“APOE ε1”和“APOE ε2”,这是载脂蛋白E基因的等位基因。APOE等位基因(ε2、ε3、ε4)是许多疾病的重要遗传因素,包括阿尔茨海默病。数字(例如,3和4)指的是个体拥有的特定等位基因,ε4与较高的阿尔茨海默病风险相关。: 收集参与者随时间变化的数据这些字符串代表的是不同的访问或评估时间点,可能是与阿尔茨海默病神经影像倡议(ADNI)相关的研究的一部分。在管理医疗影像数据时,这两个日期都很重要。

2023-11-16 20:36:58 652 1

原创 【OASISdata】

D:.| code_regress.rar| oasis_info.rar|±–code_regress| config.py| dataloader.py| dataset.py| main.py| main_test.py| models.py| run.job|±–data_oasis| oasis_cluster.csv| oasis_dHOFC_shen

2023-11-16 20:28:14 121 1

原创 【在集群上打开matlab】

【代码】【在集群上打开matlab】

2023-11-16 10:35:04 218 1

原创 【BME 2112】W6 notes

T2⋆。

2023-11-06 22:37:52 107 1

原创 【DTI】

您提供的文件和文件夹列表似乎与神经影像数据集的某种结构有关,可能是BIDS (Brain Imaging Data Structure) 的格式,这是一个为神经影像数据建议的标准化结构。总的来说,这个文件和文件夹结构表示了一个包含多个参与者(患者和对照组)的神经影像数据集,每个参与者可能都有自己的影像数据和相关信息。可能指的是扫描的方向或采集策略(例如,前后(Anterior-Posterior)和后前(Posterior-Anterior)方向)。文件名中的差异可能表示了不同的扫描或采集方向。

2023-10-28 16:20:08 283 1

原创 【无标题】Soft-margin parameter in SVM&*Dynamic FC (Functional Connectivity) Network Construction

【代码】【无标题】Soft-margin parameter in SVM&*Dynamic FC (Functional Connectivity) Network Construction。

2023-10-27 21:08:16 45

原创 【wsl】 从wndows 复制文件到wsl

wsl 的目标路径为。

2023-10-27 09:57:45 745 2

原创 【算法设计与分析】quzi准备

2D最近点对,鸽巢原理 是6个点。

2023-10-25 15:56:35 60 1

原创 有效三角形

排序从后向前固定一条边,双指针搜索符合条件的区间,[left…right, 固定边…],如果nums[left] + nums[right] 满足条件,那么left右侧的值都满足条件,累加right-left

2023-10-25 11:51:27 53 1

原创 Can‘t call numpy() on Tensor that requires grad. Use tensor.detach().numpy() instead.

【代码】Can‘t call numpy() on Tensor that requires grad. Use tensor.detach().numpy() instead.

2023-10-21 10:19:52 587 1

原创 【将应用添加到开机自启】

【代码】【将应用添加到开机自启】

2023-10-21 10:16:26 53 1

原创 【BME2121】quiz准备

iodine(碘)/lead(铅) > bone > soft tissue > fat。

2023-10-21 10:13:41 77

原创 【FSL】

1. 在官网下载我的服务器是linux的,选择linux版本下载后将放在服务器的上2. 用python2运行py脚本进行安装(python3好像也可以)如果安装提示你输入服务器密码,有可能是权限不够,试试用root权限。3. 检查环境命令行输入如果没有东西显示则需要手动配置环境变量。1.1 命令行输入在最后面输入(fsl默认安装在目录下)如果打开后是一个空文件有可能是命令(etc/profile)输错了1.2. 在命令行输入在最后面输入。

2023-10-21 10:02:33 221 1

原创 【BME2112】W3notes

运动性失语 Audition 听觉 Wernicke’s 韦尼克氏 Cognition 认知 Emotion 情感 Vision 视力 Visual-parietal 视觉顶枕区 Visual-temporal 视觉颞叶区 Olfaction。有一些研究:Rise前会有一点下降(initial dip),这里没画出来,这个现象非共识。不同物种不同脑区:时间长度,峰值高度都会有一些不同,整体形状很相似。eg 9.4T,用液氦制冷以达到超导,我们所用的3T的是常温线圈。小动脉-》毛细血管-》小静脉。

2023-10-19 17:17:57 83

原创 【BME2112】 W2notes

在原子核内,轨道角动量是量子化的,其大小由角量子数(l)决定,而方向由磁量子数(m)决定。自旋角动量也是量子化的,其大小由自旋量子数(s)决定,通常为1/2,而方向可以是两种取向:上自旋或下自旋。薛定谔方程是量子力学的基石,它为我们提供了一种理解微观世界的工具,可以用于解释原子和分子的性质,以及更广泛的粒子物理现象。“rat”(大鼠)通常指的是较大的老鼠,而"mouse"(小鼠)指的是较小的老鼠。原子核的角动量是构成这个原子核的质子和中子的轨道角动量和自旋角动量的矢量和。

2023-10-18 16:51:41 136 1

原创 PAT机试笔记

3)如果有用户提交过,例如提交第一题编译失败了,后面该用户提交第二题编译成功了,那么应该把第一题的分数改为0分并且显示在最终排名的分数上。

2023-10-18 15:13:01 148 1

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