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RSS订阅原创 溯源精微 BinBash WGBS分析流程
BinBash 计算平台为以个专业生物计算平台，提供超快速的WGS , Meta Genome, WGBS 等高计算量的样品进行快速计算服务。已经完成了大量的人，动植物的千例以上的数据加速工作。以下为一个WGBS的核心分析流程。公众号 微信。差异甲基化部分，使用methylKit 软件包进行。4. 比对结果统计与去重复。3. 分块比对与合并。
2023-06-12 12:04:48
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原创 队列研究GATK VQSR 的高速执行方式
变异质控过滤，是下游分析非常重要的一个环节 。通常人类重测序和人类队列分析我们使用GATK VQSR模块来完成这个事情。对人少数样品的重测序，VQSR很容易完成，对于大规模的队列分析就艰难许多。 常常会碰到内存不足，处理缓慢等很多情况。BinBash 科学计算平台带您一起快速解决大规模队列分析的VQSR 过滤。先简单回顾下VQSR的命令行，其中参数意义，本文不多做讨论。gatk VariantRecalibrator \ -R $reference \ -V $input \...
2021-11-08 21:14:54
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空空如也
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