单细胞论文记录(part29)--Overcoming Expressional Drop-outs in Lineage Reconstruction from Single-Cell...

文章介绍了SClineager工具,用于从scRNA-seq数据中克服表达缺失进行谱系追踪。SClineager能准确推断细胞谱系历史,适用于肿瘤和非肿瘤组织的单细胞测序研究,解决了基于遗传学的系谱追踪中的drop-out问题。

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Overcoming Expressional Drop-outs in Lineage Reconstruction from Single-Cell RNA-Sequencing Data

Authors:Tianshi Lu, Hao Zhu, Tao Wang, et al.

Journal:Cell Reports

Year:2021

DOI:10.1016/j.celrep.2020.108589

Code:None

Supplementary:None

Highlights:

从scRNA-seq数据中调用变异体的做法受到了 "表达缺失 "的独特影响
SClineager克服了基于变异的单细胞系追踪中的表达缺失问题
SClineager能够进行个体间和个体内的单细胞谱系追踪
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