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RSS订阅原创 VASP+VTST编译安装
因为要做过渡态计算，所以编译安装了VTST，下边简单介绍以下其过程，主要参考资料为VASP 5.4.1+VTST编译安装和大师兄网部分教程，之前自己也写过安装VASP的全过程，这部分是接着之前的安装做得所以很多修改介绍的不是很详细，大家如果有问题也可以翻看之前的。1、VASP+VTST编译安装(1) 设置VTST将vasp及vtstcode软件下载解压后，进入vasp软件解压后文件夹，将vt...
2019-01-24 17:44:50
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原创 根目录磁盘空间不足，使用fdisk添加新磁盘问题
1、添加新磁盘在虚拟机设置中添加——（硬盘）下一步——（SCSI(S)）下一步——（创建新虚拟磁盘(V)）下一步——（最大磁盘大小(自己设置，我这里用的20G)）下一步——完成——确定这时虚拟机设置中硬件部分显示有两个硬盘，开机2、对磁盘进行分区首先我们查看下我们虚拟机中的磁盘情况：对于IDE接口硬盘设备文件一般为：/dev/dh[a-z]（其中第一个为/dev/dha，第二个为/de...
2019-01-23 17:18:40
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原创 makefile.include
makefile.include# Precompiler optionsCPP_OPTIONS= -DHOST=\"LinuxIFC\"\ -DMPI -DMPI_BLOCK=8000 \ -Duse_collective \ -DscaLAPACK \ -DCACHE_SIZE=4000...
2018-12-27 18:20:33
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原创 VMware 虚拟机安装VASP全过程
VMware 虚拟机安装VASP全过程楼主也是第一次安装，感觉安装起来特别的麻烦，并且在安装的过程中参考了很多别人的经验，所以把自己的安装过程分享给大家，希望对大家有所帮助。另外，其中很多设置楼主也不是很懂，也是尝试自己设置的，并不确定是否合理，欢迎各位大神给修改意见。安装CentOS7系统这部分主要参考我要自学网刘贝斯老师的Linux从零到精通教程第八节。这是一份视屏教程挺详细的，所以...
2018-12-19 14:48:05
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原创 configure: error: C compiler cannot create executables问题解决
楼主是在安装VASP过程中，安装FFTW时，出现configure: error: C compiler cannot create executables错误的，如下和之前的安装界面进行了对比发现，发现这是由于之前安装编译环境时没有glibc的依赖安装完整，之前的安装包情况如下：根据这个重新进行了安装（之前有的就不用管）yum install glibc.i686yum insta...
2018-12-18 16:11:51
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原创 CentOS yum安装libstdc++.so.6时，Error: Multilib version problems found. 问题
安装VASP的依赖时，出现多版本问题。yum install libstdc++.so.6错误信息：解决办法： 运行yum install --setopt=protected_multilib=false libstdc++ (最后的libstdc++可根据库的不同修改，如 libaio libgcc等)下载之后再次运行 yum install libstdc++.so.6 ...
2018-12-17 15:33:38
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原创 (gedit:5010): dconf-WARNING **: failed to commit changes to dconf: 连接已关闭 问题解决方法
最近在linux（CentOS）中运行gedit时发现：如果用普通用户运行，不会报错但是不会出现Preferences （首选项）等选项，不能进行基本参数的更改；如果采用su 运行则会爆出以下错误：(gedit:5010): dconf-WARNING **: failed to commit changes to dconf: 连接已关闭经过查找资料，受博文“gedit各种出错”中的案例...
2018-10-17 16:29:54
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原创 forrtl: severe（174）：SIGSEGV,segmentation fault occurred 问题解决 （ulimit -s 设置堆栈最大值）
之前用VASP计算过程中出现forrtl: severe（174）：SIGSEGV, segmentation fault occurred 的错误，如下图： 这是由于我们运行程序较大，而Linux系统初始的堆栈大小（stack size）太小的缘故。我们只要将其调大，一般把stack size设置成256M或者没有限制，这样就没有段错误了！命令为： ulimit -s 262140 或...
2018-09-14 11:12:14
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空空如也
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