各种读取csv文件的工具性能比较

在翻阅calamine作者的quick-csv存储库时无意中看到有个10年前的csv读取比赛, 把比赛选手源程序下载下来测试看到底有多快。

git clone https://bitbucket.org/ewanhiggs/csv-game.git

这些源程序只有比赛程序本身,依赖的文件有的在主页,有的在makefile中写出。冠军是一个叫csvmonkey的程序,如下所示

#include <iostream>
#include <iterator>

#include "csvmonkey.hpp"
using namespace csvmonkey;


int main(int argc, char* argv[])
{
    if(argc < 2) {
        return 1;
    }

    MappedFileCursor cursor;
    if(! cursor.open(argv[1])) {
        // new behaviour for csvmonkey returns 0 for empty files.
        std::cout << 0 << std::endl;
        return 0;
    }

    CsvReader reader(cursor);
    CsvCursor &row = reader.row();
    int sum = 0;
    
    while(reader.read_row()) {
        sum += row.count;
    }
    std::cout << sum << std::endl;
}

它的主要实现都在头文件csvmonkey.hpp里,找来编译执行了,结果不太快,500万行的读取正确,用时23秒,100万行41列的读取失败,没有文档,不知怎么改。

wget https://raw.githubusercontent.com/dw/csvmonkey/csv-game/csvmonkey.hpp

g++ csv.cc -w -pedantic -std=c++11 -g -O3 -fpic -msse4.2 -march=native -DNDEBUG -o csvmonkey -I .

root@6ae32a5ffcde:/par# time ./csvmonkey "5m Sales Records.csv"
70000000

real    0m23.437s
user    0m0.388s
sys     0m1.325s
root@6ae32a5ffcde:/par# time ./csvmonkey "NYC_311_SR_2010-2020-sample-1M.csv"
1060693607
Segmentation fault (core dumped)

real    0m19.954s
user    0m0.194s
sys     0m1.147s

再拿基于libcsv的程序来测,它在列表中是第8名

#include <csv.h>
#include <stdio.h>
#include <string.h>

void field_count(void* str, size_t str_len, void* data) {
    int* count = (int*)data;
    *count += 1;
}

const int READ_SZ = 1024 * 1024;

int main (int argc, char* argv[]) {
    struct csv_parser parser = {0};
    csv_init(&parser, CSV_APPEND_NULL);
    FILE* f = fopen(argv[1], "r");
    char *buf = (char*)malloc(READ_SZ);
    size_t buflen = READ_SZ;
    int count = 0; 
    while((buflen = fread(buf, 1, READ_SZ, f))  > 0){
        csv_parse(&parser, buf, buflen, field_count, 0, &count);
    }
    printf("%d\n", count);
    fclose(f);
    free(buf);
    csv_free(&parser);
    return EXIT_SUCCESS;
}

效果好了很多,都在3秒左右,但读出的列数有点差距,应该是标题行影响,但第一个难以理解,14列怎么读成13列了。

gcc csv.c libcsv.c -Werror -Wall -pedantic -std=c11 -g -O3 -fpic -march=native -o libcsv -I .
root@6ae32a5ffcde:/par# time ./libcsv "5m Sales Records.csv"
70000013

real    0m3.608s
user    0m1.301s
sys     0m0.100s
root@6ae32a5ffcde:/par# time ./libcsv "NYC_311_SR_2010-2020-sample-1M.csv"
41000041

real    0m3.078s
user    0m1.083s
sys     0m0.109s

再拿我常用的Duckdb来读,效率高了很多。读取统计行数都在2秒左右,写入内存表也不过增加了0.2秒。对读入的数据进行总结,内容也都正确。

D .timer on
D SET enable_progress_bar =false;

D select count(*) from '5m Sales Records.csv';
┌────────────────┐
│  count_star()  │
│     int64      │
├────────────────┤
│    5000000     │
│ (5.00 million) │
└────────────────┘
Run Time (s): real 2.329 user 0.998917 sys 0.234929
D select count(*) from 'NYC_311_SR_2010-2020-sample-1M.csv';
┌────────────────┐
│  count_star()  │
│     int64      │
├────────────────┤
│    1000000     │
│ (1.00 million) │
└────────────────┘
Run Time (s): real 1.981 user 0.649826 sys 0.196659
D create table t as from '5m Sales Records.csv';
Run Time (s): real 2.585 user 3.853148 sys 0.752251
D summarize t;
┌────────────────┬─────────────┬─────────────┬────────────────────┬───┬────────────────────┬─────────┬─────────────────┐
│  column_name   │ column_type │     min     │        max         │ … │        q75         │  count  │ null_percentage │
│    varcharvarcharvarcharvarchar       │   │      varchar       │  int64  │  decimal(9,2)   │
├────────────────┼─────────────┼─────────────┼────────────────────┼───┼────────────────────┼─────────┼─────────────────┤
│ Region         │ VARCHAR     │ Asia        │ Sub-Saharan Africa │ … │ NULL50000000.00 │
│ Country        │ VARCHAR     │ Afghanistan │ Zimbabwe           │ … │ NULL50000000.00 │
│ Item TypeVARCHAR     │ Baby Food   │ Vegetables         │ … │ NULL50000000.00 │
│ Sales Channel  │ VARCHAR     │ Offline     │ Online             │ … │ NULL50000000.00 │
│ Order Priority │ VARCHAR     │ C           │ M                  │ … │ NULL50000000.00 │
│ Order DateDATE2010-01-012020-09-10         │ … │ 2018-01-0850000000.00 │
│ Order ID       │ BIGINT100000321999999892          │ … │ 77539938850000000.00 │
│ Ship DateDATE2010-01-012020-10-30         │ … │ 2018-02-0150000000.00 │
│ Units Sold     │ BIGINT110000              │ … │ 749850000000.00 │
│ Unit Price     │ DOUBLE9.33668.27             │ … │ 428.793747566488850000000.00 │
│ Unit Cost      │ DOUBLE6.92524.96             │ … │ 307.0304857341750000000.00 │
│ Total Revenue  │ DOUBLE9.336682700.0          │ … │ 1823813.983183333750000000.00 │
│ Total Cost     │ DOUBLE6.925249600.0          │ … │ 1203364.150452026950000000.00 │
│ Total Profit   │ DOUBLE2.411738700.0          │ … │ 566819.027875001550000000.00 │
├────────────────┴─────────────┴─────────────┴────────────────────┴───┴────────────────────┴─────────┴─────────────────┤
│ 14 rows                                                                                         12 columns (7 shown) │
└──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
Run Time (s): real 0.792 user 10.106701 sys 0.037936
D create table t2 as from 'NYC_311_SR_2010-2020-sample-1M.csv';
Run Time (s): real 2.285 user 2.901837 sys 0.686295
D summarize t2;
┌──────────────────────┬─────────────┬──────────────────────┬───┬──────────────────────┬─────────┬─────────────────┐
│     column_name      │ column_type │         min          │ … │         q75          │  count  │ null_percentage │
│       varcharvarcharvarchar        │   │       varchar        │  int64  │  decimal(9,2)   │
├──────────────────────┼─────────────┼──────────────────────┼───┼──────────────────────┼─────────┼─────────────────┤
│ Unique KeyBIGINT11465364             │ … │ 4020821610000000.00 │
│ Created DateTIMESTAMP2010-01-01 00:00:00  │ … │ 2018-07-30 12:48:4…  │ 10000000.00 │
│ Closed DateTIMESTAMP1900-01-01 00:00:00  │ … │ 2018-08-04 11:42:5…  │ 10000002.86 │
│ Agency               │ VARCHAR3-1-1                │ … │ NULL10000000.00 │
│ Agency Name          │ VARCHAR3-1-1                │ … │ NULL10000000.00 │
│ Complaint TypeVARCHAR../../WEB-INF/web.…  │ … │ NULL10000000.00 │
│ Descriptor           │ VARCHAR1 Missed Collection  │ … │ NULL10000000.30 │
│ Location TypeVARCHAR1-, 2- and 3- Fami…  │ … │ NULL100000023.91 │
│ Incident Zip         │ VARCHAR*                    │ … │ NULL10000005.50 │
│ Incident Address     │ VARCHAR* *                  │ … │ NULL100000017.47 │
│ Street Name          │ VARCHAR*                    │ … │ NULL100000017.47 │
│ Cross Street 1VARCHAR1 AVE                │ … │ NULL100000032.04 │
│ Cross Street 2VARCHAR1 AVE                │ … │ NULL100000032.36 │
│ Intersection Stree…  │ VARCHAR1 AVE                │ … │ NULL100000076.74 │
│ Intersection Stree…  │ VARCHAR1 AVE                │ … │ NULL100000076.77 │
│ Address TypeVARCHAR     │ ADDRESS              │ … │ NULL100000012.58 │
│ City                 │ VARCHAR*                    │ … │ NULL10000006.20 │
│ Landmark             │ VARCHAR1 AVENUE             │ … │ NULL100000091.28 │
│ Facility TypeVARCHAR     │ DSNY Garage          │ … │ NULL100000014.55 │
│ StatusVARCHAR     │ Assigned             │ … │ NULL10000000.00 │
│ Due DateTIMESTAMP1900-01-02 00:00:00  │ … │ 2017-09-22 19:44:2…  │ 100000064.78 │
│ Resolution Descrip…  │ VARCHAR     │ A DOB violation wa…  │ … │ NULL10000002.05 │
│ Resolution Action …  │ TIMESTAMP2009-12-31 01:35:00  │ … │ 2018-08-10 13:25:1…  │ 10000001.51 │
│ Community Board      │ VARCHAR0 Unspecified        │ … │ NULL10000000.00 │
│ BBL                  │ VARCHAR0000000000           │ … │ NULL100000024.30 │
│ Borough              │ VARCHAR     │ BRONX                │ … │ NULL10000000.00 │
│ X Coordinate (Stat…  │ BIGINT913281               │ … │ 101825510000008.53 │
│ Y Coordinate (Stat…  │ BIGINT121152               │ … │ 23490710000008.53 │
│ Open Data Channel …  │ VARCHAR     │ MOBILE               │ … │ NULL10000000.00 │
│ Park Facility Name   │ VARCHAR"Uncle" Vito F. Ma…  │ … │ NULL10000000.00 │
│ Park Borough         │ VARCHAR     │ BRONX                │ … │ NULL10000000.00 │
│ Vehicle TypeVARCHAR     │ Ambulette / Paratr…  │ … │ NULL100000099.97 │
│ Taxi Company Borough │ VARCHAR     │ BRONX                │ … │ NULL100000099.92 │
│ Taxi Pick Up Locat…  │ VARCHAR1 5 AVENUE MANHATTAN │ … │ NULL100000099.21 │
│ Bridge Highway Name  │ VARCHAR145th St. Br - Len…  │ … │ NULL100000099.77 │
│ Bridge Highway Dir…  │ VARCHAR     │ Bronx Bound          │ … │ NULL100000099.77 │
│ Road Ramp            │ VARCHAR     │ N/A                  │ … │ NULL100000099.77 │
│ Bridge Highway Seg…  │ VARCHAR1-1-1265963747       │ … │ NULL100000099.76 │
│ Latitude             │ DOUBLE40.1123853           │ … │ 40.80288457482914100000025.47 │
│ Longitude            │ DOUBLE-77.5195844          │ … │ -73.87602468658496100000025.47 │
│ Location             │ VARCHAR(40.1123853, -77.5…  │ … │ NULL100000025.47 │
├──────────────────────┴─────────────┴──────────────────────┴───┴──────────────────────┴─────────┴─────────────────┤
│ 41 rows                                                                                     12 columns (6 shown) │
└──────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────────┘
Run Time (s): real 0.332 user 2.741898 sys 0.049018

补记:
我用calamine作者的参赛代码quick-reader编译时报错,将源文件交给张泽鹏先生审查,他说那是古早的格式,现在Cargo.toml要加入edition = “2024”,依赖代码的版本也修改为quick-csv ="0.1.6"就能正常编译了

quick-reader修改前Cargo.toml

[package]

name = "quick-reader"
version = "0.0.1"
authors = [ "Johann Tuffe <tafia973@gmail.com>" ]

[[bin]]
name = "quick-reader"

[dependencies]
quick-csv = "0.1"

[profile.release]
opt-level = 3
lto = true

quick-reader修改后Cargo.toml

[package]
name = "quick-reader"
version = "0.1.0"
edition = "2024"

[dependencies]
quick-csv = "0.1.6"

quick-reader源代码将extern crate quick_csv as csv;改为use quick_csv as csv;同时添加use std;并把::std改为std。
修改前

extern crate quick_csv as csv;

fn main() {
    let fpath = ::std::env::args().nth(1).unwrap();
    let rdr = csv::Csv::from_file(fpath).unwrap();
    let sum = rdr.into_iter()
                 .map(|r| r.unwrap().len())
                 .fold(0usize, |c, n| c + n);
    println!("{}", sum);
}

修改后

use quick_csv as csv;
use std;

fn main() {
    let fpath = std::env::args().nth(1).unwrap();
    let rdr = csv::Csv::from_file(fpath).unwrap();
    let sum = rdr.into_iter()
                 .map(|r| r.unwrap().len())
                 .fold(0usize, |c, n| c + n);
    println!("{}", sum);
}

编译执行

time /par/quick-reader/target/release/quick-reader /par/NYC_311_SR_2010-2020-sample-1M.csv
41000041

real    0m9.702s
user    0m0.449s
sys     0m0.394s
time /par/quick-reader/target/release/quick-reader "/par/5m Sales Records.csv"
70000014

real    0m12.335s
user    0m0.636s
sys     0m0.564s

还是不如libcsv快, 但是结果很正确,一个字段都不差。

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