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RSS订阅原创 DTI提取结构矩阵自动化脚本
如上图所示，我有95个文件，所以文件夹命名就是1-95。每个文件夹内需要准备dti.nii.gz（原始DTI文件），dti.bvec，dti.bval，T1.nii.gz（原始T1文件），命名就像这么命名。根据自己的数据及情况修改代码即可。首先运行001.sh文件。
2025-06-03 13:30:14
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原创 全网目前最完整最详细的DTI提取结构矩阵教程，跟着一步步做就一定能做出来（注：没有任何套路，亲测过程ok，结果ok）
摘要：本文详细介绍了结合MRtrix3、ANTS和FSL工具处理DTI数据并生成纤维束连接矩阵的全流程。从环境准备（安装FSL、MRtrix3和ANTS）、数据预处理（DTI去噪、Gibbs矫正等）、T1处理、DTI-T1配准，到纤维追踪、模板配准和最终连接矩阵生成。作者强调需逐步验证每个处理步骤的效果，并提供了两种矩阵转换方法。虽然目前流程包含手动操作步骤，但该方法能有效生成纤维束和结构连接矩阵，为后续研究提供基础。
2025-05-29 10:22:46
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原创 提取DTI数据的结构连接矩阵(使用fsl工具，用到T1影像，用纤维束追踪法)
sub-XX_T1_to_MNI_warp.nii.gz是形变场文件，是非线性配准结果。修改输入文件目录为自己的路径，我这里将输出目录默认输出在源文件夹了（应该新建一个子文件夹用来区分比较好），输出内容有去颅骨文件（sub-XX_T1_brain.nii.gz），脑掩膜文件（sub-XX_T1_brain_mask.nii.gz），脑轮廓叠加图像文件（sub-XX_T1_brain_overlay.nii.gz），因为后面只需要去颅骨文件，其他两个文件就可以省略了（删了也行，省的占内存）。
2025-05-26 09:28:27
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空空如也
空空如也
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