
医学图像处理
JYZhang_sh
本人自己多加加油~
上海高校机器学习研究僧小菜鸟一枚~
交流可发邮件1459416934@qq.com
展开
-
Shape-Aware Meta-Learning 在模型泛化中引入形状约束
论文来源:Liu, Quande, Qi Dou, and Pheng-Ann Heng. “Shape-aware Meta-learning for Generalizing Prostate MRI Segmentation to Unseen Domains.” In International Conference on Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention, pp. 475-485. Springer, Cham,原创 2020-11-05 17:13:31 · 3070 阅读 · 0 评论 -
Continual Learning 经典方法:Memory Aware Synapses (MAS)
1. 顾名思义Synapses 是神经元的突触,在人脑中负责连接不同神经元结构。Hebb’s rule 表示在脑生理学中,突触连接常常满足 “Fire Together, Wire Together”,即同时被激活或者同时失活。所以不同的任务对应潜在的不同突触——不同的记忆,因此选择激活或者改变某些神经元突触即可称为 Memory Aware Synapses (MAS)。在基于深度模型的终身学习任务中来说,可以通过计算网络中神经元的重要性,来选择保持重要的神经元在终身学习过程中相对不变,而不重要的神经原创 2020-11-03 17:17:48 · 4065 阅读 · 6 评论 -
one-shot 语义分割算法
文章出处 Shaban, Amirreza, et al. “One-shot learning for semantic segmentation.” arXiv preprint arXiv:1709.03410 (2017).One-Shot Semantic Segmentation 问题定义当 测试集中出现新类(不包括在训练集中),同时在测试集中仅仅 给定该新类的一张图片和对应语义分...原创 2020-03-22 18:20:57 · 2683 阅读 · 0 评论 -
形状一致的生成对抗网络 SC-GAN —— 无监督域适应
形状一致的生成对抗网络 SC-GAN —— 无监督域适应文章原文:Yu, Fei, et al. “Annotation-Free Cardiac Vessel Segmentation via Knowledge Transfer from Retinal Images.” International Conference on Medical Image Computing and Comp...原创 2020-03-17 17:50:21 · 1863 阅读 · 0 评论 -
MICCAI2019论文分享 PART①
刚刚结束的 MICCAI2019 会议的论文集分为6个部分,这段时间刷了一遍 Part I,在这儿和大家做一个简单的分享交流。由于本人主要专注于分割领域和半监督弱监督等学习策略,下面给出的综述可能多涉及该方向。选出的文章主要突出其中的闪光点,如果感兴趣还望各位移步 link 官网获取原文。如果阐述有误也欢迎大家拍砖指教。为话不多说,直接开始。1. Dual Encoding U-Ne...原创 2019-10-29 17:21:32 · 9809 阅读 · 11 评论 -
用于医学图像分割的数据增强方法 —— 标准 imgaug 库的使用方法
用于医学图像分割的数据增强方法 —— 标准 imgaug 库的使用方法前言 —— imgaug 库简介在机器学习算法尤其是 deep learning 盛行的如今,数据增强是实现深度学习不可避免的一个重要环节。相比于 tensorflow 或者 pytorch 自带的数据增强库而言,基于 imgaug 库的数据增强具有更加友好的 API 和更加丰富的功能。下面主要介绍在医学图像分割算法中,i...原创 2019-10-15 22:28:12 · 10470 阅读 · 3 评论 -
Backpropagating Refinement Scheme for Interactive Segmentation 反向传播修正机制 (CVPR2019)
Motivation传统的基于深度学习的交互式分割框架利用前向传播得到的结果,还是存在一定的偏差(比如交互部位在最后的分割结果中依然会被分割错)。因此提出 backpropagating refinement scheme 进行修正。注意:这里的 backpropagating 不是用来训练模型参数的,而是用来修正 annotation map 的。算法流程Training phas...原创 2019-09-04 17:43:22 · 1833 阅读 · 2 评论 -
利用持续同调在基于深度学习的分割框架中引入显式的拓扑学约束
在基于深度学习的图像分割中利用持续同调引入显式拓扑学约束Motivation目前主流的图像分割框架都是类似全卷积方式的多尺度框架(U-Net等), 虽然他们能够利用图像邻域关系来辅助逐像素的分割,但是损失函数依然只独立地考虑每个像素点, 并不能考虑高阶的拓扑学结构. 因此往往会导致即使有比较低的逐像素的loss, 然是会造成拓扑学结构的改变, 从而带来分割结果的显著恶化(断裂或空洞等现象). ...原创 2019-07-16 21:52:02 · 3700 阅读 · 3 评论 -
From FCN to U-Net:经典分割网络的前世今生
关于Fully Convolution Network的一些细节介绍可以参考博主的另一篇文章:http://blog.youkuaiyun.com/jyzhang_cvml/article/details/79451749. 随着FCN提出,在2015年医学图像处理顶会MICCAI上,Olaf Ronneberger 设计了名为 U-Net 的医学图像分割网络。作者在文章中表示该网络具有两大优势:(1)在较少的原创 2018-03-07 15:37:46 · 1708 阅读 · 1 评论 -
图像分割之 Geodesic segmentation 和 Graph-Cut
最近心血来潮了解了一波 Graph-cut 和 geodesic segmentation 分割算法。翻阅了整个中文区域的博客发现鲜有人讲解 geodesic segmentatio 。索性将自己的一些见解写成这篇博客和大家交流。本文把 geodesic segmentation 和 graph-cut 串联在一起希望帮助大家理解。 具体 graph-cut 相关内容网上很多人都有介绍,在此不再赘述原创 2017-10-26 22:01:48 · 4496 阅读 · 3 评论 -
Mathematical Morphology —— Path Operator
关于数学形态学的基本操作 Dilation, Erosion, Closing 和 Opening 操作在此不再赘述,各种博文满天飞。这篇博客简要介绍一下当前一种比较新的 Mathematical Morphology 操作 —— Path Operator 和 RoRPO。1 . Concept需要注意的,我们所提及的所有滤波器都是 Oriented Filter ,直观理解就是这种滤波器是具有特原创 2017-10-11 21:09:50 · 709 阅读 · 0 评论 -
Atlas-based segmentation 浅析
初见 —— Atlas-based segmentationAtlas 的中文翻译很贴切且形象,所谓“地图集”,直观来说,Atlas 就是人工标记完备的数据库。比如 BrainWeb 的 Atlas:在三维脑部CT数据中医生标注完备的各种脑部结构,如灰质、白质、海马等等结构。 最早的 Atlas-based segmentation 是基于 nonrigid registration 技术,原创 2017-09-20 21:49:30 · 9838 阅读 · 3 评论