windows上用anaconda安装marvin包并读取本地cube文件

说在前面：
anaconda最好在安装的时候就加入环境变量！
make sure to check both the “Add Anaconda to my PATH environment variable” and “Register Anaconda as my default Python 3.6”
虽然不添加好像也能运行，但是会出一堆warning，原因见Installation — Marvin 2.8.0 documentation  Marvin on Windows

安装marvin步骤：

1.新建环境python 3.8，命令行输入：conda create -n marvin python=3.8

2.激活环境，命令行输入：conda activate marvin

3.安装marvin，命令行输入：pip install sdss-marvin

4.找一个地方放marvin的HOME环境，比如D:\\marvin，并在该目录放入一个.netrc格式的文件，文件名随便，不需要写内容，然后在每个用到marvin包的程序开头加入下面几行：
import os
os.environ['HOME'] = 'D:\\marvin'
os.environ['SAS_BASE_DIR'] = os.path.join(os.getenv("HOME"), 'sas')

5.用pip uninstall卸载并更换下面版本的包

a.问题：ImportError: cannot import name 'escape' from 'jinja2’
   解决：安装jinja2版本小于3.1，命令行输入：pip install -U "jinja2>3,<3.1"
见https://github.com/sdss/marvin/issues/791

b.问题：cannot import name 'json' from 'itsdangerous’
   解决：安装itsdangerous版本，命令行输入：pip install itsdangerous==2.0.1
见https://github.com/sdss/marvin/issues/815

c.问题：drpall-v3_1_1.fits cannot be found. Setting drpall to None.
   解决：python程序中开头加入：
from marvin import config
config.switchSasUrl(sasmode='mirror')
config.mode = 'local'
见https://github.com/sdss/marvin/issues/816，https://github.com/sdss/marvin/issues/810#issuecomment-2176729494

注意：其他的包packaging版本为20.9，werkzeug版本为2.0.3，其他默认

6.更改C:\Users\XX\anaconda3\envs\marvin\lib\site-packages\marvin\tools\cube.py中的第180和181行代码：
将180行with gunzip(self.filename) as gg:注释掉，改为#with gunzip(self.filename) as gg:
将181行self.data = fits.open(self.filename)向前缩进，改为self.data = fits.open(self.filename)

7.最终一个可以读取本地manga数据cube的marvin程序开头如下：
import os
os.environ['HOME'] = 'D:\\marvin'
os.environ['SAS_BASE_DIR'] = os.path.join(os.getenv("HOME"), 'sas')
from marvin import config
config.switchSasUrl(sasmode='mirror')
config.mode = 'local'
from marvin.tools import Cube
directory='目录\\manga-7443-12703-LOGCUBE.fits.gz'
cube = Cube(filename=directory)

最后：本来第5步弄完应该就可以了，但是用Cube读取本地fits文件的时候说找不到文件：
OSError: filename XX\\XX\\manga-7443-12703-LOGCUBE.fits.gz' cannot be found: [Errno 13] Permission denied: 'C:\\Users\\XX\\AppData\\Local\\Temp\\tmp4ys03e44'
网上查了一堆说是临时文件产生不了，可能是临时文件读写权限有问题，但是用管理员运行spyder或者anaconda也解决不了，更高级的办法不知道，看了下报错的代码有一行是源代码读取本地数据的函数，也就是第6步那里cube.py文件的180和181行有问题，里面用了个gunzip什么玩意好像要解压文件，明明astropy的fits.open就能直接读取.gz的压缩fits文件，为什么还要多此一举解压一遍还要再Temp里搞个临时文件，然后还没有权限，服了。

注：以上情况适用于2024.10.28以前2.8.0的marvin安装，测试可以在21H2和24H2的win11上运行，anaconda版本为2.6.3，anaconda最好在安装的时候就加入环境变量，不加好像也能用，但是有warning报错。