# 安装包已打包至data文件夹, 可直接双击安装
shell.exec("data")
生信软件安装原则
- 软件安装路径非常有用, 要安装在容易找到的目录下
- 新手建议添加桌面快捷方式, 防止找不到安装位置。快捷方式-右键属性-文件位置可查看安装路径
- 软件安装路径不能有中文, 以免软件无法识别中文路径
- 建议安装在
D
盘,在D盘新建文件夹software
,所有的软件安装在其下面 - 软件语言英文可能比中文更好, 英文优先
添加系统环境变量
- 为什么需要: 系统无法自动识别软件命令的位置, 需要手动指定搜索路径
- 这个技能你必须要会,windows 系统添加环境变量
R下载和安装
- R代码的运行依赖于R这个软件
- 要先安装R再安装RStudio,否则RStudio无法正常启动,顺序搞错了就全删了重新按顺序安装
- 安装包链接:https://cran.r-project.org/bin/windows/base/old/4.4.1/
选择exe
二进制安装包。- 安装的时候注意安装路径不能有中文!生信相关软件的安装目录及项目路径均是如此,以免软件无法识别中文路径。
- 建议安装在
D
盘,在D盘新建文件夹software
,所有的软件安装在其下面。 - 语言:使用默认英语,不要选择中文,因为信息以英文展示更准确
- 安装位置 :
D:/software/R-4.4.1
Rstudio的安装和使用
- 必须先安装R,再安装Rstudio
- 安装包链接:https://posit.co/download/rstudio-desktop/
- 安装路径选择
D:/software/RStudio
- 选择安装的R版本
Rtools的安装
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R的一些操作依赖于Rtools里面的一些工具,需要单独安装,也是安装在software文件夹下。
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安装包链接:https://cran.r-project.org/bin/windows/Rtools/rtools44/rtools.html
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双击RStudio图标能正常打开, 说明安装成功