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J_Fun
这个作者很懒，什么都没留下…
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sratoolkit_fastq-dump
软件包下载：wget ftp-trace.ncbi.nlm.nih.gov/sra/sdk/current/sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz解压：tar-xzf sratoolkit.current-centos_linux64.tar.gz运行程序在解压文件夹中的bin文件夹中：ps：在运行程序之前，先检查lin原创 2017-03-07 09:12:05 · 4642 阅读 · 0 评论 -
BWA and Bowtie
BWA——Burrows-Wheeler AlignerInstallation下载：http://sourceforge.net/projects/bio-bwa/files/压缩文件解压缩：$tar xvfj bwa-0.7.12.tar.bz2转至目录：$cd bwa-0.7.12编译：$make测试：$./bwa #正常情况下会出现帮助信息Run原创 2017-03-02 20:50:45 · 1571 阅读 · 0 评论 -
FastQC
软件下载：http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/下载为一个zip文件；Linux中安装：1.unzip对文件解压得到FastQC文件夹2.打开FastQC文件夹，用chmod u+u fastqc命令，给fastqc这个主程序增加可执行属性3.命令行运行 fastqc [-o output原创 2017-03-02 17:14:29 · 8165 阅读 · 0 评论