session 问题

问个问题，如下：
我要在一个A系统中，通过一个弹出窗口，超链接到另一个系统B中去， 但是考虑到session,有可能出问题。弹出窗口请求B系统，则B系统会写session,这个时候，B写的sessionID，会不会将A的sessionID覆盖掉呢？ 因为弹出窗口与父窗口是一个进程。

哪位高手能指点下？谢谢！