生信脚本练习(5)求fastq文件的cg含量

本文介绍了一种求解fastq文件中CG含量的方法,虽然不是最优化方案,但通过使用Counter函数,使得过程变得简单易行。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >

这道题要求求出一个fastq文件中序列的cg含量

with open("Test1.fastq","r") as f:
    lines = f.readlines()
seq = []
index = []
cg_n = []
cg_percentage = []
head = ['Read', 'CG']
cg = open("cg.txt","w") 
#这里精髓,取出每条序列的标题
for line in lines:
    if lines.index(line) %4== 
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