hard_cry的博客

原创 missMethyl R包在DNA甲基化的富集分析当中的应用

DNA甲基化的富集分析不同于GWAS，因为CpG位点在每个基因或基因启动子之间的分布是不均衡的，不同基因对应的探针数也有很大的差异，所以不能直接用“cluster Profiler”来做GO分析和KEGG分析。那DNA甲基化的富集分析用什么工具呢？Bingo~答案就是文章标题中的“missMethyl”R包了。它可以通过加权重抽样和Wallenius非中心超几何近似法矫正“多基因偏差”和“多探针偏差”。下面是相关的代码。