医学图像分割与数据分类算法的研究与应用
1. 肌肉骨骼组织分割技术
1.1 数据采集
在对人体小腿区域进行研究时,采用 3T MRI(Siemens SkyraTM,Malvern,PA)系统来获取所需的图像。具体操作如下:
- 让受试者脚先进入躺在扫描仪上。
- 将 16 通道的膝盖线圈放置在小腿周长最大的部位。
对于 T2 加权图像,采用长时间扫描,回波时间(TE)设为 51 ms,重复时间(TR)设为 2120 ms。视野(FOV)为 512 × 512,有 14 个切片。像素尺寸在 X - Y - Z 轴上设置为 0.5 mm × 0.5 mm × 2.4 mm。
脂肪和水的图像通过光谱拟合技术获得,捕捉 6 个回波,用于不同相位的水和 - CH2(亚甲基)自旋重叠,TE 为 1.4 ms,TR 为 12 ms,翻转角为 4°。通过对不同自旋重叠处的信号进行合适的多项式拟合,提取出仅含脂肪和仅含水的图像。最后,利用高分辨率 T2 图像将脂肪和水的图像配准到一个公共空间,使用开源工具 FSL 进行 3D 逐片配准。
1.2 组织识别与分割方法
组织识别
分析的肢体是人体小腿区域,其轴向切片呈现四个主要区域:皮下脂肪、骨骼肌、胫骨和腓骨的骨皮质以及它们各自的骨髓。
组织和皮肤掩码
使用分割脚本,从配准的同相图像创建组织掩码,这有助于保留相关信息并消除重采样图像的背景。然后,通过形态学操作侵蚀组织掩码,生成皮肤掩码,它可用于配准灌注图像并去除任何穿透伪影。
分离单个组成组织
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