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生物信息学分析:R语言的高效应用指南
1.编程语言学习经历分享2.R语言数据操作技巧3.R语言与windows系统、Linux服务器及使用方法4.R 语言与生物信息数据的联系5.多组学数据的分析方法6.R语言在生物信息学中的应用1.R语言发展脉络2.R与工作目录(工作目录,切换工作目录)3.R的数据类型及结构 (数值型、逻辑型、字符型、向量、列表、数据框、矩阵)4.R中各数据类型的赋值与操作(针对不同数据类型进行赋值、批量读取数据、通过循环对数据进行计算、差异分析)原创 2024-08-29 09:56:44 · 1438 阅读 · 0 评论 -
R语言Meta分析核心技术:回归诊断与模型验证
R语言作为一种强大的统计分析和绘图语言,在科研领域发挥着日益重要的作用。其中,Meta分析作为一种整合多个独立研究结果的统计方法,在R语言中得到了广泛的应用。通过R语言进行Meta分析,研究者能够更为准确、全面地评估某一研究问题的现状和发展趋势。R语言在Meta分析中的应用主要体现在数据整合、效应量计算、异质性检验以及结果可视化等方面。利用R语言的各种包(package),研究者可以方便地导入和处理数据,计算不同研究的效应量,并通过统计模型检验各研究间的异质性。原创 2024-03-21 18:37:34 · 1732 阅读 · 0 评论 -
ArcGIS Pro与R:携手优化生态系统服务评估流程
生态系统服务是指生态系统所形成的用于维持人类赖以生存和发展的自然环境条件与效用,是人类直接或间接从生态系统中得到的各种惠益。联合国千年生态系统评估(Millennium ecosystem assessment,MA)提出生态系统服务包括供给、调节、支持、文化服务,但自然条件和人类需求使得生态系统服务之间形成了此消彼长的权衡关系或相互增益的协同关系。原创 2024-03-20 18:31:50 · 1440 阅读 · 0 评论 -
R语言扩展包与MaxEnt模型的集成:实现高效的物种分布模拟
在生态学研究中,物种分布模拟是一项至关重要的任务。它有助于我们理解物种与环境之间的复杂关系,预测物种在气候变化或人类活动影响下的潜在分布变化。近年来,随着计算机技术的不断发展,基于机器学习的物种分布模拟方法逐渐成为研究热点。其中,MaxEnt模型作为一种广泛应用的物种分布预测工具,其准确性和稳定性得到了广泛认可。而R语言,作为一种强大的统计分析和数据可视化工具,为MaxEnt模型的应用提供了便捷的平台。MaxEnt模型基于最大熵原理,通过整合环境变量和物种分布数据,构建物种分布的概率模型。原创 2024-03-11 19:14:32 · 1331 阅读 · 0 评论 -
R语言lavaan结构方程模型在复杂网络分析中的科研技术新趋势
1)R及Rstudio介绍:背景、软件及程序包安装、基本设置等2)R语言基本操作,包括向量、矩阵、数据框及数据列表等生成和数据提取等3)R语言数据文件读取、整理(清洗)、结果存储等(含tidverse)4)R语言基础绘图(含ggplot):基本绘图、排版、发表质量绘图输出存储1)SEM的定义、生态学领域应用及历史回顾2)SEM的基本结构3)SEM的估计方法4)SEM的路径规则5)SEM路径参数的含义6)SEM分析样本量及模型可识别规则7)SEM构建基本流程。原创 2024-03-07 19:05:07 · 982 阅读 · 0 评论