UCSD计算生物学——1.Introduction

坚持好好写博客，做社会主义好少年。

课程名称：Bioinformatics Algorithm: An active learning approach

Instructor: Dr. PABLO & Dr. Phillips Campos

UCSD的课程，对入门计算生物学有特别大的帮助。 教学视频来自于Youtube。 在Coursera上也有该课程，但是有规定的时间安排，来不及看。

该博客将关注该课程的知识要点，配套Biopython的代码实现，参考经典书籍（列举如下），给自己以督促，以飨有需之人。

参考书籍：

1. Bioinformatics Sequence and Genomic Analysis

2. An Introduction of Bioinformatic Algorithm

(经师兄推荐目前在参考这两本书。据说前者更加偏向生物科学方面，后者更加注重算法的研究)

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Introduction：

计算生物学：多用字符串查找，图论和机器学习的知识解决基因序列等生物学上的问题。问题包括：

1.生物序列的片段拼接。

2.序列对接。
3.基因识别：人类长达30个亿DNA序列中只有3%-5%是基因。阐明人体中全部基因的位置，结构，功能，表达等。
4.蛋白质结构预测