蛋白软件安装资源文件

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资源描述

本仓库提供了一系列用于蛋白结构分析和处理的软件安装包，涵盖了并行计算环境、GPU加速工具以及多种蛋白分析软件。以下是资源文件的详细列表：

主要软件包

1. 并行环境

   • OpenMPI

2. GPU加速工具

   • Relion GPU版（包含fftw、fltk）

3. 蛋白分析软件

   • Coot
   • PyMOL
   • Gautomatch
   • Gctf
   • Frealign
   • Bsoft
   • Ctffind
   • DoGpicker
   • Resmap
   • MotionCor2
   • MotionCorr
   • Eman2.2
   • Spider
   • Chimera

安装说明

环境要求

• 操作系统：Linux（推荐使用Ubuntu或CentOS）
• GPU：支持CUDA的NVIDIA显卡
• 内存：至少16GB
• 硬盘空间：至少100GB

安装步骤

1. 下载资源文件

   • 从本仓库下载所有资源文件。

2. 安装依赖库

   • 使用以下命令安装必要的依赖库：

     sudo apt-get update
     sudo apt-get install -y build-essential cmake libfftw3-dev libfltk1.3-dev
     

3. 安装OpenMPI

   • 解压OpenMPI安装包，进入目录并执行以下命令：

     ./configure --prefix=/usr/local
     make -j4
     sudo make install
     

4. 安装Relion GPU版

   • 解压Relion安装包，进入目录并执行以下命令：

     mkdir build
     cd build
     cmake -DCUDA=ON ..
     make -j4
     sudo make install
     

5. 安装其他软件

   • 按照每个软件包内的README文件进行安装。

注意事项

• 安装过程中可能会遇到依赖库版本不匹配的问题，请根据错误提示进行相应的调整。
• 部分软件可能需要手动配置环境变量，请参考各自的安装文档。

联系我们

如果在安装过程中遇到任何问题，欢迎通过GitHub Issues联系我们，我们将尽快为您提供帮助。

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