PBScan 项目使用教程

PBScan 项目使用教程

pbscanFaster and more efficient stateless SYN scanner and banner grabber due to userland TCP/IP stack usage.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/pb/pbscan

1. 项目的目录结构及介绍

pbscan/
├── example_data/
│   ├── list1.txt
│   ├── list2.txt
│   ├── list3.txt
│   └── example.ms
├── gitattributes
├── LICENSE
├── PBScan_manual.pdf
├── README.md
├── pbscan.c
└── pbscan.h

目录结构介绍

• example_data/: 包含示例数据文件，如 list1.txt, list2.txt, list3.txt 和 example.ms。
• gitattributes: Git 属性文件。
• LICENSE: 项目许可证文件，采用 GPL-3.0 许可证。
• PBScan_manual.pdf: PBScan 的用户手册。
• README.md: 项目的自述文件，包含项目的基本信息和使用说明。
• pbscan.c: 项目的主要源代码文件。
• pbscan.h: 项目的头文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 pbscan.c。该文件包含了 PBScan 的主要功能实现，包括选择性外显子扫描和群体分支统计分析。

启动文件内容概述

• pbscan.c: 该文件包含了 PBScan 的核心代码，用于执行选择性外显子扫描和群体分支统计分析。用户可以通过编译该文件来生成可执行文件 pbscan。

3. 项目的配置文件介绍

项目中没有明确的配置文件，但用户可以通过命令行参数来配置 PBScan 的行为。以下是一些常用的命令行参数：

• -likes: 指定基因型似然文件。
• -pop1: 定义属于第一个群体的个体列表。
• -pop2: 定义属于第二个群体的个体列表。
• -pop3: 定义属于外群的个体列表。
• -out: 指定输出文件名。
• -win: 指定滑动窗口的大小。
• -step: 指定滑动窗口的步长。
• -ms: 指定中性数据文件。
• -div: 指定群体分化估计的参数。
• -min: 指定每个群体的最小个体数。
• -maf: 指定最小等位基因频率。

使用示例

./pbscan -likes example.likes -pop1 list1.txt -pop2 list2.txt -pop3 list3.txt -out output -win 50 -step 51 -ms example.ms -div 2 -min 5 -maf 0.05

以上命令将使用 example.likes 文件中的基因型似然数据，结合 list1.txt, list2.txt, list3.txt 中的个体列表，进行选择性外显子扫描，并将结果输出到 output 文件中。

pbscanFaster and more efficient stateless SYN scanner and banner grabber due to userland TCP/IP stack usage.项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/pb/pbscan