particles:项目的核心功能/场景
particles Sequential Monte Carlo in python 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/part/particles
Sequential Monte Carlo in python。
项目介绍
particles 是一个用于顺序蒙特卡洛(Sequential Monte Carlo,SMC)方法的 Python 库。SMC 方法是一类用于解决复杂概率问题的计算方法,尤其适用于状态空间模型。该项目的开发旨在补充尼古拉斯·乔平(Nicolas Chopin)和奥米罗斯·帕帕斯皮利普洛斯(Omiros Papaspiliopoulos)所著的书籍《An introduction to Sequential Monte Carlo》。除此之外,particles 还实现了该书籍出版后引入的算法和方法。
项目技术分析
particles 项目的核心是顺序蒙特卡洛方法,它通过递归地构建一系列随机样本(粒子)来近似后验分布。这种方法在处理时间序列数据、滤波、平滑以及贝叶斯参数推断中具有广泛的应用。
在技术实现上,particles 提供了以下功能和特性:
- 粒子滤波:包括引导滤波、粒子滤波、APF 等方法。
- 重采样:支持多项式、余数、分层、系统性和 SSP 重采样方法。
- 状态空间模型:支持定义具有基本概率编程形式的状态空间模型。
- SQMC(顺序准蒙特卡洛):提供计算希尔伯特曲线和生成 RQMC 序列的例程。
- FFBS(前向滤波后向采样):包括标准、O(N^2) 变种,以及基于 MCMC、纯拒绝或混合方案的更快变种。
- 其他平滑算法:包括固定滞后平滑、在线平滑、两种滤波器平滑(O(N) 和 O(N^2) 变种)。
- 精确滤波/平滑算法:适用于线性高斯模型的卡尔曼滤波和有限隐藏马尔可夫模型的向前-向后递归。
- 标准和无浪费 SMC 采样器:包括 SMC 温度调节、IBIS(数据温度调节)等。
- 贝叶斯参数推断:适用于状态空间模型的 PMCMC(PMMH、粒子吉布斯)和 SMC^2。
- 并行计算支持:支持在不同 CPU 核心上运行多个 SMC 算法。
- 方差估计器:包括多种方差估计方法。
- 嵌套采样:包括标准版本和 SMC 采样器。
项目及技术应用场景
particles 项目的应用场景广泛,包括但不限于以下领域:
- 时间序列分析:例如股票市场的价格预测、天气模型的模拟等。
- 滤波与平滑:在信号处理中,用于估计信号的动态状态。
- 贝叶斯统计推断:在机器学习和数据分析中,用于推断模型参数。
- 目标跟踪:在雷达、声纳等系统中,用于跟踪移动目标的位置和速度。
- 生物信息学:在基因表达数据分析中,用于估计基因调控网络的参数。
项目特点
particles 项目的特点如下:
- 功能丰富:涵盖了粒子滤波、平滑、参数推断等多种 SMC 方法。
- 易于使用:提供直观的 API 和丰富的文档,易于上手和集成到现有项目中。
- 性能高效:支持并行计算,提高了算法的执行效率。
- 社区支持:由活跃的社区维护,不断更新和改进。
- 教学友好:提供了多种示例和教程,方便学习和研究。
以下是定义状态空间模型的示例代码:
import particles
import particles.state_space_models as ssm
import particles.distributions as dists
class ToySSM(ssm.StateSpaceModel):
def PX0(self): # 分布函数 X_0
return dists.Normal() # X_0 ~ N(0, 1)
def PX(self, t, xp): # 分布函数 X_t 给定 X_{t-1}
return dists.Normal(loc=xp) # X_t ~ N( X_{t-1}, 1)
def PY(self, t, xp, x): # 分布函数 Y_t 给定 X_t
return dists.Normal(loc=x, scale=self.sigma) # Y_t ~ N(X_t, sigma^2)
现在,您可以选择此类别中的特定模型,并从中生成数据:
my_model = ToySSM(sigma=0.2)
x, y = my_model.simulate(200) # 样本大小为 200
运行引导粒子滤波器,只需简单操作:
alg = particles.SMC(fk=ssm.Bootstrap(ssm=my_model, data=y), N=200)
alg.run()
particles 项目为顺序蒙特卡洛方法提供了一个强大且灵活的框架,无论是对于研究者还是开发者来说,都是值得一试的工具。访问官方文档了解更多示例、说明和安装指导。
particles Sequential Monte Carlo in python 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/part/particles
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考