普林斯顿大学HPC入门工作坊项目教程

普林斯顿大学HPC入门工作坊项目教程

hpc_beginning_workshop 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/hp/hpc_beginning_workshop

1. 项目的目录结构及介绍

hpc_beginning_workshop/
├── data/
│   ├── input/
│   └── output/
├── docs/
│   ├── slides/
│   └── README.md
├── scripts/
│   ├── setup.sh
│   └── run.sh
├── config/
│   ├── config.yaml
│   └── env.sh
├── src/
│   ├── main.py
│   └── utils.py
├── README.md
└── LICENSE

目录结构介绍

• data/: 存放项目的数据文件，包括输入数据和输出数据。

  • input/: 存放输入数据文件。
  • output/: 存放输出数据文件。

• docs/: 存放项目的文档文件，包括幻灯片和README文件。

  • slides/: 存放项目介绍的幻灯片文件。
  • README.md: 项目的文档说明文件。

• scripts/: 存放项目的脚本文件，包括设置和运行脚本。

  • setup.sh: 项目的环境设置脚本。
  • run.sh: 项目的运行脚本。

• config/: 存放项目的配置文件。

  • config.yaml: 项目的配置文件。
  • env.sh: 项目的环境变量配置文件。

• src/: 存放项目的源代码文件。

  • main.py: 项目的主程序文件。
  • utils.py: 项目的工具函数文件。

• README.md: 项目的总体说明文件。

• LICENSE: 项目的许可证文件。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动文件是 scripts/run.sh。该脚本负责启动项目的运行，通常会调用 src/main.py 文件来执行主要的计算任务。

run.sh 文件内容示例

#!/bin/bash

# 设置环境变量
source config/env.sh

# 运行主程序
python src/main.py

启动文件介绍

• run.sh: 该脚本首先加载环境变量配置文件 config/env.sh，然后调用 python src/main.py 来启动项目的主程序。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置文件主要存放在 config/ 目录下，包括 config.yaml 和 env.sh。

config.yaml 文件内容示例

# 项目配置文件
project:
  name: "HPC Beginning Workshop"
  version: "1.0.0"

data:
  input_dir: "data/input"
  output_dir: "data/output"

parameters:
  num_cores: 4
  memory_limit: "8GB"

env.sh 文件内容示例

# 环境变量配置文件
export PYTHONPATH=$PYTHONPATH:$(pwd)/src
export DATA_DIR=$(pwd)/data

配置文件介绍

• config.yaml: 该文件使用YAML格式，定义了项目的名称、版本、数据目录和运行参数等信息。
• env.sh: 该文件定义了项目运行所需的环境变量，如 PYTHONPATH 和 DATA_DIR。

通过这些配置文件，用户可以方便地调整项目的运行环境和参数设置。

hpc_beginning_workshop 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/hp/hpc_beginning_workshop