LillyMol 开源项目教程

LillyMol 开源项目教程

LillyMol LillyMol Public Code 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/li/LillyMol

1. 项目的目录结构及介绍

LillyMol 是一个基于 C++ 的化学信息学库，同时包含了一系列实用的命令行工具。以下是项目的目录结构及其简要介绍：

• contrib: 贡献者目录，可能包含贡献者的代码和相关文件。
• data: 数据目录，存储项目所需的数据文件。
• docs: 文档目录，包含项目的文档和教程。
• example: 示例目录，包含使用 LillyMol 的示例代码。
• githooks: Git 钩子目录，包含 Git 仓库钩子脚本。
• src: 源代码目录，包含 LillyMol 的核心代码。
• test: 测试目录，包含对 LillyMol 功能的单元测试。
• .devcontainer: 开发容器配置文件。
• .github: GitHub 工作流和配置文件。
• Dockerfile: Docker 配置文件，用于创建容器镜像。
• LICENSE: 项目许可证文件，本项目采用 Apache-2.0 许可。
• Makefile: Makefile 文件，用于构建项目。
• NEWS.md: 项目更新日志。
• README.md: 项目说明文件，介绍了项目的背景和基本信息。
• docker-compose.yml: Docker Compose 配置文件，用于定义多容器应用。
• run_python.sh: Python 运行脚本。

2. 项目的启动文件介绍

项目的启动主要是通过 Makefile 文件进行的。以下是一些基本的构建命令：

• make: 默认构建命令，将编译源代码并生成可执行文件。
• make python: 构建包含 Python 绑定的版本。
• make berkeleydb: 构建包含 BerkeleyDB 依赖的版本。
• make all: 构建完整版本，包含所有可选特性。

构建完成后，可执行文件将位于 bin/$(uname) 目录下，库文件位于 lib 目录。

3. 项目的配置文件介绍

项目的配置主要通过 Makefile 和 WORKSPACE 文件进行。以下是配置文件的简要介绍：

• Makefile: 包含构建项目的指令和变量。可以通过编辑此文件来设置编译选项、路径和其他参数。
• WORKSPACE: Bazel 的配置文件，用于定义外部依赖和构建环境。如果需要构建 Python 绑定，可能需要更新此文件以反映本地 Python 的位置。

在构建之前，确保已经正确设置了所有必要的依赖和配置。如果需要自定义安装目录，可以编辑 build_deps/install.bzl 文件，但请注意，每次运行 make 命令时，这个文件都会被自动更新。

通过以上介绍，您应该对 LillyMol 的目录结构、启动方式和配置有了基本的了解。接下来，您可以按照这些指示开始构建和使用这个项目。

LillyMol LillyMol Public Code 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/li/LillyMol