如何使用StatAnnotations：在Seaborn图中添加统计显著性标注

如何使用StatAnnotations：在Seaborn图中添加统计显著性标注

statannotations 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/st/statannotations

---

项目介绍

StatAnnotations是Python的一个库，专为基于seaborn绘制的图表设计，旨在轻松地进行统计测试，并添加显著性标注。该项目继承了statannot的特性并进行了进一步开发，引入了错误修复、新功能以及一个不同的API。从版本0.4.0起，它不再兼容旧版statannot的接口，鼓励用户采用更新的功能。StatAnnotations支持多种图表类型（如箱型图、条形图、群集点图、带状图及小提琴图）和内置的统计测试，如Mann-Whitney U测试、t检验等，同时也允许集成任意外部统计函数。此外，它提供了对多重比较校正的支持和高度可定制化的注释格式。

项目快速启动

首先，确保你的环境中安装了必要的依赖项，包括Python 3.6以上版本、numpy、seaborn（版本需小于0.12）、matplotlib、pandas以及可选的statsmodels（用于多重比较校正）。你可以通过以下命令来安装StatAnnotations：

pip install statannotations

或者如果你想安装带有所有可选依赖项的完整版本，以支持更多功能：

pip install -r requirements.txt

接下来，快速展示如何在seaborn绘制的箱线图上添加显著性标注：

import seaborn as sns
from statannotations.Annotator import Annotator
import pandas as pd

# 加载示例数据
df = sns.load_dataset('tips')
x = "day"
y = "total_bill"
order = ['Sun', 'Thur', 'Fri', 'Sat']

# 绘制箱线图
ax = sns.boxplot(data=df, x=x, y=y, order=order)

# 定义要比较的配对
pairs = [("Thur", "Fri"), ("Thur", "Sat"), ("Fri", "Sun")]

# 初始化Annotator对象
annotator = Annotator(ax, pairs, data=df, x=x, y=y, order=order)

# 配置测试方法和注释样式
annotator.configure(test='Mann-Whitney', text_format='star', loc='outside')

# 应用并显示注释
annotator.apply_and_annotate()

这段代码将在指定的配对间，基于Mann-Whitney U测试的结果，在箱线图上自动添加相应的显著性星号标注。

应用案例与最佳实践

在实际研究或数据分析项目中，StatAnnotations可以用来增强可视化效果，明确指出不同组别之间的统计差异。最佳实践建议事先确定合适的统计测试，正确配置注释的位置和格式，以确保图表既美观又信息丰富。对于复杂的数据分析，利用FacetGrid与StatAnnotations结合可以展现多维度下变量间的统计关系。

典型生态项目

虽然StatAnnotations本身专注于统计标注功能，但它经常被结合到更广泛的数据科学项目中，特别是在生物医学研究、社会科学、市场分析等领域，其中对数据可视化中的统计显著性要求较高。用户可以在自己的研究论文、报告或演示文稿中利用StatAnnotations，以科学严谨的方式呈现seaborn图表的分析结果。

---

通过以上指南，开发者能够快速上手StatAnnotations，提升他们图表的表达力和准确性，无论是日常的数据探索还是专业的学术发表都能得心应手。

statannotations 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/st/statannotations