gapseq 项目推荐

gapseq 项目推荐

gapseq Informed prediction and analysis of bacterial metabolic pathways and genome-scale networks 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ga/gapseq

1. 项目基础介绍和主要编程语言

gapseq 是一个专注于细菌代谢途径预测和分析的开源项目。该项目结合了代谢途径分析与代谢网络重建和校正，基于基因组信息和多种数据库，能够进行代谢途径的预测、转运蛋白的推断、代谢模型的构建以及多步缺口填充。gapseq 的主要编程语言包括 R、HTML、Shell、Jupyter Notebook、Python 和 Perl。

2. 项目的核心功能

gapseq 的核心功能包括：

• 代谢途径预测：基于多种数据库，预测细菌的代谢途径。
• 转运蛋白推断：通过基因组信息推断可能的转运蛋白。
• 代谢模型构建：根据预测的途径和推断的转运蛋白，构建完整的代谢模型。
• 多步缺口填充：通过多步分析，填补代谢模型中的缺口，使其更加完整和准确。

3. 项目最近更新的功能

gapseq 最近的更新功能包括：

• 版本更新：最新版本为 v1.3.1，发布于 2024 年 8 月 26 日。
• 功能优化：对代谢途径预测算法进行了优化，提高了预测的准确性。
• 文档更新：更新了详细的安装和使用教程，帮助用户更快上手。
• 错误修复：修复了之前版本中的一些已知问题，提升了项目的稳定性。

通过这些更新，gapseq 在代谢途径预测和分析方面的能力得到了进一步提升，为用户提供了更加可靠和高效的工具。

gapseq Informed prediction and analysis of bacterial metabolic pathways and genome-scale networks 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ga/gapseq