global-chem：公共化学列表的知识图谱

global-chem：公共化学列表的知识图谱

global-chem A Knowledge Graph of Common Chemical Names to their Molecular Definition 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/gl/global-chem

项目介绍

global-chem 是一个开源的公共化学列表字典，以通用化学名称作为输入，输出 SMILES/SMARTS 格式，通过相应的社区组织成知识图谱。该项目的目标是作为基础库，用于管理我们日常生活中的各种化学品（如食品、衣物、环境、材料、药物、战争等）对人类的好处。

global-chem 的愿景是构建一个全面的化学知识库，为科研人员、化学工程师和爱好者提供一个统一的平台，以便更好地理解和利用化学物质。

项目技术分析

global-chem 采用了先进的知识图谱技术，通过将化学物质的名称、结构、属性和关系映射成一个图结构，实现了化学物质的系统组织。以下是项目的技术特点：

• 数据结构：使用图结构来表示化学物质之间的关联，每个节点代表一种化学物质，边表示化学物质之间的联系。
• 数据输入：接受通用化学名称作为输入，通过内置的转换器生成 SMILES/SMARTS 格式。
• 模块化设计：global-chem 设计为多个模块，用户可以根据需要安装特定的模块，如化学信息学、生物信息学、量子化学等。
• 兼容性：global-chem 可以与多种化学信息工具兼容，如 RDKit、PartialSMILES、DeepSMILES 等。

项目及技术应用场景

global-chem 的应用场景广泛，以下是一些主要的应用领域：

1. 科研：化学家可以使用 global-chem 来查找和分析化学物质的性质，加速新药物的研发。
2. 教育：教师和学生可以使用 global-chem 作为学习化学知识和结构的工具。
3. 材料科学：工程师可以利用 global-chem 来优化材料的设计和性能。
4. 环境科学：环保人员可以使用 global-chem 来评估化学物质对环境的影响。

项目特点

以下是 global-chem 的一些主要特点：

• 开放性：作为开源项目，global-chem 鼓励社区贡献和反馈，持续改进和扩展。
• 统一性：通过知识图谱的构建，global-chem 提供了一个统一的方式来表示和管理化学信息。
• 扩展性：global-chem 的模块化设计允许用户根据需要添加新的化学列表和功能。
• 准确性：global-chem 的数据经过严格的验证，确保了化学信息的准确性和可靠性。

如何使用 global-chem

global-chem 可以通过 PyPi 进行安装，用户可以根据需要选择安装不同的模块。以下是一些安装示例：

pip install global-chem
pip install 'global-chem[graphing]'
pip install 'global-chem[forcefields]'
pip install 'global-chem[bioinformatics]'
pip install 'global-chem[quantum_chemistry]'
pip install 'global-chem[development_operations]'
pip install 'global-chem[all]'

安装后，用户可以通过以下代码来构建 global-chem 的网络，并获取特定化学物质的 SMILES：

from global_chem import GlobalChem
gc = GlobalChem()
gc.build_global_chem_network()
molecules = list(gc.get_node_smiles('pihkal').values())
print (molecules)

global-chem 的开源特性使得它成为了一个强大的化学知识管理工具，无论是对于科研人员还是教育工作者，都能带来极大的便利和效率提升。通过社区的不断贡献和完善，global-chem 有望成为化学信息学领域的重要资源。

global-chem A Knowledge Graph of Common Chemical Names to their Molecular Definition 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/gl/global-chem