MPI教程:深入理解Scatter、Gather和Allgather操作
mpitutorial 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mpi/mpitutorial
概述
在并行计算领域,MPI(Message Passing Interface)是最常用的通信标准之一。本文将重点讲解MPI中的三个核心集合通信操作:MPI_Scatter
、MPI_Gather
和MPI_Allgather
。这些操作在数据分发和收集场景中扮演着至关重要的角色。
MPI_Scatter详解
基本概念
MPI_Scatter
是一种将数据从根进程分发到通信域内所有进程的操作。与广播(MPI_Bcast
)不同,MPI_Scatter
不是简单地将相同数据发送给所有进程,而是将数组的不同部分分发给不同的进程。
工作原理
想象一个包含N个元素的数组,当使用MPI_Scatter
时:
- 根进程(通常是rank 0)持有完整的数组
- 数组被均匀分割成多个部分
- 每个部分按照进程rank顺序分发到对应进程
函数原型
MPI_Scatter(
void* send_data, // 发送数据缓冲区(仅在根进程有效)
int send_count, // 发送给每个进程的元素数量
MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
void* recv_data, // 接收数据缓冲区
int recv_count, // 接收的元素数量
MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
int root, // 根进程rank
MPI_Comm communicator // 通信域
)
使用场景
MPI_Scatter
特别适合数据并行计算场景,比如:
- 矩阵运算中将矩阵分块处理
- 大规模数据集的分割处理
- 任何需要将工作负载均匀分布到多个进程的情况
MPI_Gather详解
基本概念
MPI_Gather
是MPI_Scatter
的逆操作,它将来自多个进程的数据收集到根进程。这在需要合并计算结果时非常有用。
工作原理
- 每个进程提供自己的数据块
- 根进程按照进程rank顺序收集这些数据块
- 最终在根进程形成一个完整的数组
函数原型
MPI_Gather(
void* send_data, // 发送数据缓冲区
int send_count, // 发送的元素数量
MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
void* recv_data, // 接收数据缓冲区(仅在根进程有效)
int recv_count, // 从每个进程接收的元素数量
MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
int root, // 根进程rank
MPI_Comm communicator // 通信域
)
注意事项
- 只有根进程需要提供有效的接收缓冲区
- 其他进程可以将
recv_data
设为NULL recv_count
是从每个进程接收的元素数量,不是总数
实践案例:计算数组平均值
让我们通过一个实际例子来理解这些操作的应用。我们将实现一个并行计算数组平均值的程序。
算法步骤
- 根进程生成随机数数组
- 使用
MPI_Scatter
将数组分发给所有进程 - 每个进程计算自己部分的平均值
- 使用
MPI_Gather
将所有部分平均值收集到根进程 - 根进程计算最终平均值
关键代码片段
// 根进程创建随机数数组
if (world_rank == 0) {
rand_nums = create_rand_nums(elements_per_proc * world_size);
}
// 分配接收缓冲区
float *sub_rand_nums = malloc(sizeof(float) * elements_per_proc);
// 分发数据
MPI_Scatter(rand_nums, elements_per_proc, MPI_FLOAT, sub_rand_nums,
elements_per_proc, MPI_FLOAT, 0, MPI_COMM_WORLD);
// 计算局部平均值
float sub_avg = compute_avg(sub_rand_nums, elements_per_proc);
// 收集部分平均值
float *sub_avgs = NULL;
if (world_rank == 0) {
sub_avgs = malloc(sizeof(float) * world_size);
}
MPI_Gather(&sub_avg, 1, MPI_FLOAT, sub_avgs, 1, MPI_FLOAT, 0,
MPI_COMM_WORLD);
// 计算最终平均值
if (world_rank == 0) {
float avg = compute_avg(sub_avgs, world_size);
}
MPI_Allgather详解
基本概念
MPI_Allgather
是MPI_Gather
的变体,它不仅将数据收集到根进程,而是将数据收集到所有进程。可以将其视为MPI_Gather
后接一个MPI_Bcast
的组合操作。
工作原理
- 每个进程提供自己的数据块
- 所有进程都会收到完整的数据集合
- 数据按照进程rank顺序排列
函数原型
MPI_Allgather(
void* send_data, // 发送数据缓冲区
int send_count, // 发送的元素数量
MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
void* recv_data, // 接收数据缓冲区
int recv_count, // 从每个进程接收的元素数量
MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
MPI_Comm communicator // 通信域
)
修改后的平均值计算程序
我们可以修改之前的平均值计算程序,使用MPI_Allgather
让所有进程都能获得最终结果:
// 收集所有部分平均值到所有进程
float *sub_avgs = (float *)malloc(sizeof(float) * world_size);
MPI_Allgather(&sub_avg, 1, MPI_FLOAT, sub_avgs, 1, MPI_FLOAT,
MPI_COMM_WORLD);
// 所有进程计算最终平均值
float avg = compute_avg(sub_avgs, world_size);
性能考虑
- 负载均衡:确保
send_count
合理分配,避免某些进程过载 - 内存使用:
MPI_Allgather
会在所有进程创建完整数据集副本,需注意内存消耗 - 通信开销:对于大型数据集,集合操作可能成为性能瓶颈
总结
本文详细介绍了MPI中的三种重要集合通信操作:
MPI_Scatter
:将数据从根进程分发到所有进程MPI_Gather
:将数据从所有进程收集到根进程MPI_Allgather
:将数据从所有进程收集到所有进程
这些操作是构建复杂并行算法的基础,理解它们的特性和适用场景对于开发高效的MPI程序至关重要。通过平均值计算的例子,我们看到了如何在实际问题中应用这些操作。
mpitutorial 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/mpi/mpitutorial
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考