MPI教程:深入理解Scatter、Gather和Allgather操作

MPI教程:深入理解Scatter、Gather和Allgather操作

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概述

在并行计算领域,MPI(Message Passing Interface)是最常用的通信标准之一。本文将重点讲解MPI中的三个核心集合通信操作:MPI_ScatterMPI_GatherMPI_Allgather。这些操作在数据分发和收集场景中扮演着至关重要的角色。

MPI_Scatter详解

基本概念

MPI_Scatter是一种将数据从根进程分发到通信域内所有进程的操作。与广播(MPI_Bcast)不同,MPI_Scatter不是简单地将相同数据发送给所有进程,而是将数组的不同部分分发给不同的进程。

工作原理

想象一个包含N个元素的数组,当使用MPI_Scatter时:

  • 根进程(通常是rank 0)持有完整的数组
  • 数组被均匀分割成多个部分
  • 每个部分按照进程rank顺序分发到对应进程

函数原型

MPI_Scatter(
    void* send_data,       // 发送数据缓冲区(仅在根进程有效)
    int send_count,        // 发送给每个进程的元素数量
    MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
    void* recv_data,       // 接收数据缓冲区
    int recv_count,        // 接收的元素数量
    MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
    int root,             // 根进程rank
    MPI_Comm communicator  // 通信域
)

使用场景

MPI_Scatter特别适合数据并行计算场景,比如:

  • 矩阵运算中将矩阵分块处理
  • 大规模数据集的分割处理
  • 任何需要将工作负载均匀分布到多个进程的情况

MPI_Gather详解

基本概念

MPI_GatherMPI_Scatter的逆操作,它将来自多个进程的数据收集到根进程。这在需要合并计算结果时非常有用。

工作原理

  • 每个进程提供自己的数据块
  • 根进程按照进程rank顺序收集这些数据块
  • 最终在根进程形成一个完整的数组

函数原型

MPI_Gather(
    void* send_data,       // 发送数据缓冲区
    int send_count,        // 发送的元素数量
    MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
    void* recv_data,       // 接收数据缓冲区(仅在根进程有效)
    int recv_count,        // 从每个进程接收的元素数量
    MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
    int root,             // 根进程rank
    MPI_Comm communicator  // 通信域
)

注意事项

  • 只有根进程需要提供有效的接收缓冲区
  • 其他进程可以将recv_data设为NULL
  • recv_count是从每个进程接收的元素数量,不是总数

实践案例:计算数组平均值

让我们通过一个实际例子来理解这些操作的应用。我们将实现一个并行计算数组平均值的程序。

算法步骤

  1. 根进程生成随机数数组
  2. 使用MPI_Scatter将数组分发给所有进程
  3. 每个进程计算自己部分的平均值
  4. 使用MPI_Gather将所有部分平均值收集到根进程
  5. 根进程计算最终平均值

关键代码片段

// 根进程创建随机数数组
if (world_rank == 0) {
    rand_nums = create_rand_nums(elements_per_proc * world_size);
}

// 分配接收缓冲区
float *sub_rand_nums = malloc(sizeof(float) * elements_per_proc);

// 分发数据
MPI_Scatter(rand_nums, elements_per_proc, MPI_FLOAT, sub_rand_nums,
            elements_per_proc, MPI_FLOAT, 0, MPI_COMM_WORLD);

// 计算局部平均值
float sub_avg = compute_avg(sub_rand_nums, elements_per_proc);

// 收集部分平均值
float *sub_avgs = NULL;
if (world_rank == 0) {
    sub_avgs = malloc(sizeof(float) * world_size);
}
MPI_Gather(&sub_avg, 1, MPI_FLOAT, sub_avgs, 1, MPI_FLOAT, 0,
           MPI_COMM_WORLD);

// 计算最终平均值
if (world_rank == 0) {
    float avg = compute_avg(sub_avgs, world_size);
}

MPI_Allgather详解

基本概念

MPI_AllgatherMPI_Gather的变体,它不仅将数据收集到根进程,而是将数据收集到所有进程。可以将其视为MPI_Gather后接一个MPI_Bcast的组合操作。

工作原理

  • 每个进程提供自己的数据块
  • 所有进程都会收到完整的数据集合
  • 数据按照进程rank顺序排列

函数原型

MPI_Allgather(
    void* send_data,       // 发送数据缓冲区
    int send_count,        // 发送的元素数量
    MPI_Datatype send_datatype, // 发送数据类型
    void* recv_data,       // 接收数据缓冲区
    int recv_count,        // 从每个进程接收的元素数量
    MPI_Datatype recv_datatype, // 接收数据类型
    MPI_Comm communicator  // 通信域
)

修改后的平均值计算程序

我们可以修改之前的平均值计算程序,使用MPI_Allgather让所有进程都能获得最终结果:

// 收集所有部分平均值到所有进程
float *sub_avgs = (float *)malloc(sizeof(float) * world_size);
MPI_Allgather(&sub_avg, 1, MPI_FLOAT, sub_avgs, 1, MPI_FLOAT,
              MPI_COMM_WORLD);

// 所有进程计算最终平均值
float avg = compute_avg(sub_avgs, world_size);

性能考虑

  1. 负载均衡:确保send_count合理分配,避免某些进程过载
  2. 内存使用MPI_Allgather会在所有进程创建完整数据集副本,需注意内存消耗
  3. 通信开销:对于大型数据集,集合操作可能成为性能瓶颈

总结

本文详细介绍了MPI中的三种重要集合通信操作:

  • MPI_Scatter:将数据从根进程分发到所有进程
  • MPI_Gather:将数据从所有进程收集到根进程
  • MPI_Allgather:将数据从所有进程收集到所有进程

这些操作是构建复杂并行算法的基础,理解它们的特性和适用场景对于开发高效的MPI程序至关重要。通过平均值计算的例子,我们看到了如何在实际问题中应用这些操作。

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创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考

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