ATOM3D 项目使用教程

ATOM3D 项目使用教程

atom3d ATOM3D: tasks on molecules in three dimensions 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/at/atom3d

1. 项目目录结构及介绍

ATOM3D 项目的目录结构如下：

atom3d/
├── docs/
├── examples/
├── licenses/
├── tests/
├── github/workflows/
├── env_template/
├── gitattributes
├── gitignore
├── readthedocs.yml
├── LICENSE
├── Makefile
├── README.md
├── codecov.yml
├── pytest.ini
├── requirements.txt
├── setup.py
└── tox.ini

目录介绍

• docs/: 存放项目的文档文件。
• examples/: 存放项目的示例代码。
• licenses/: 存放项目的许可证文件。
• tests/: 存放项目的测试代码。
• github/workflows/: 存放 GitHub Actions 的工作流配置文件。
• env_template/: 存放环境配置模板文件。
• gitattributes: Git 属性配置文件。
• gitignore: Git 忽略文件配置。
• readthedocs.yml: Read the Docs 配置文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• Makefile: 项目的 Makefile 文件，用于自动化构建和测试。
• README.md: 项目的 README 文件，包含项目的基本介绍和使用说明。
• codecov.yml: Codecov 配置文件，用于代码覆盖率报告。
• pytest.ini: Pytest 配置文件，用于配置测试框架。
• requirements.txt: 项目依赖的 Python 包列表。
• setup.py: 项目的安装脚本。
• tox.ini: Tox 配置文件，用于多环境测试。

2. 项目启动文件介绍

ATOM3D 项目的启动文件主要是 setup.py 和 Makefile。

setup.py

setup.py 是 Python 项目的标准安装脚本，用于定义项目的元数据和依赖项。通过运行以下命令可以安装项目：

pip install .

Makefile

Makefile 是一个自动化构建工具，用于编译、测试和部署项目。常见的命令包括：

• make install: 安装项目依赖。
• make test: 运行项目的测试。
• make docs: 生成项目的文档。

3. 项目的配置文件介绍

ATOM3D 项目的配置文件主要包括以下几个：

pytest.ini

pytest.ini 是 Pytest 的配置文件，用于配置测试框架的行为。例如，可以设置测试的输出格式、测试路径等。

codecov.yml

codecov.yml 是 Codecov 的配置文件，用于配置代码覆盖率报告的行为。可以设置覆盖率的阈值、报告的格式等。

tox.ini

tox.ini 是 Tox 的配置文件，用于配置多环境测试。可以定义不同的 Python 版本和依赖环境，确保项目在不同环境下都能正常运行。

readthedocs.yml

readthedocs.yml 是 Read the Docs 的配置文件，用于配置文档的构建和部署。可以设置文档的版本、构建命令等。

通过这些配置文件，可以灵活地管理和配置 ATOM3D 项目的各个方面，确保项目的稳定性和可维护性。

atom3d ATOM3D: tasks on molecules in three dimensions 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/at/atom3d