cBioPortal开源项目常见问题解决方案

cBioPortal开源项目常见问题解决方案

cbioportal cBioPortal for Cancer Genomics 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cb/cbioportal

1. 项目基础介绍和主要编程语言

cBioPortal是一个针对癌症基因组学的开源项目，它提供了可视化、分析和下载大规模癌症基因组数据集的功能。该项目旨在帮助研究人员和医生更好地理解癌症的基因特征，从而为癌症的预防、诊断和治疗提供支持。

主要编程语言：

• Java（后端）
• JavaScript（前端）

2. 新手在使用这个项目时需要特别注意的3个问题及解决步骤

问题一：如何搭建项目的开发环境？

解决步骤：

1. 确保已安装Java 8或更高版本。
2. 安装MySQL数据库，并创建一个数据库实例。
3. 克隆项目仓库到本地：

   git clone https://github.com/cBioPortal/cbioportal.git
   

4. 使用Docker Compose来搭建开发环境，运行以下命令：

   docker-compose up -d
   

5. 确保Docker服务正在运行，并在浏览器中访问http://localhost:8080来查看项目。

问题二：如何运行单元测试？

解决步骤：

1. 在项目根目录下，运行以下Maven命令来安装所有依赖：

   mvn install
   

2. 运行以下命令来执行单元测试：

   mvn test
   

3. 查看测试结果，确保所有测试通过。

问题三：如何贡献代码到项目？

解决步骤：

1. 阅读项目README文件和CONTRIBUTING.md文件，了解项目贡献流程。
2. 克隆项目到本地，并创建一个新分支：

   git checkout -b new-feature-branch
   

3. 在新分支上开发你的新功能或修复bug。
4. 确保所有更改都遵循项目的代码风格和规范。
5. 提交你的更改，并推送到远程仓库：

   git commit -m "Feature: Add new feature"
   git push origin new-feature-branch
   

6. 在GitHub上创建一个Pull Request，并等待项目维护者的审查。

通过以上步骤，新手可以顺利地搭建cBioPortal的开发环境，运行单元测试，并参与到项目的贡献中。

cbioportal cBioPortal for Cancer Genomics 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/cb/cbioportal