YASA项目安装与配置指南

YASA项目安装与配置指南

yasa YASA (Yet Another Spindle Algorithm): a Python package to analyze polysomnographic sleep recordings. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ya/yasa

1. 项目基础介绍

YASA（Yet Another Spindle Algorithm）是一个基于Python的开源项目，主要用于分析多导睡眠图（polysomnographic sleep recordings）的睡眠分析工具箱。它提供了自动化睡眠分期、事件检测（如睡眠纺锤波、慢波和快速眼动等）、伪迹剔除、频谱分析、睡眠统计及阶段转换分析等功能。

2. 项目使用的关键技术和框架

• 编程语言：Python
• 关键技术：
  • NumPy：用于高性能的数学计算。
  • Pandas：数据操作和分析工具。
  • MNE (Magnetoencephalography (MEG) and Electroencephalography (EEG) analysis)：用于脑电图和磁电图数据的预处理和分析。
  • Numba：用于加速数值计算。
• 框架：无特定框架，主要是基于Python的标准库和一些科学计算相关的库。

3. 项目安装和配置的准备工作与详细步骤

准备工作

• 确保你的系统中已安装Python。YASA支持Python 3.7及以上版本。
• 安装必要的依赖库：NumPy、Pandas、MNE和Numba。

安装步骤

方法一：使用pip安装

1. 打开终端或Anaconda命令提示符。

2. 输入以下命令安装YASA：

   pip install --upgrade yasa
   

方法二：使用conda安装

1. 如果使用的是Conda环境，首先需要添加conda-forge通道：

   conda config --add channels conda-forge
   conda config --set channel_priority strict
   

2. 然后使用以下命令安装YASA：

   conda install yasa
   

方法三：从源代码安装

1. 克隆项目仓库或下载源代码压缩包并解压缩。

2. 进入解压后的YASA目录。

3. 使用以下命令安装YASA：

   pip install ".[test]"
   

   或者使用以下命令进行可编辑安装：

   pip install --editable ".[test]"
   

4. 安装完成后，可以使用以下命令测试安装是否成功：

   pytest
   

以上步骤为基本的安装流程，具体使用时可能还需要根据个人需求调整配置或安装额外的库。安装完成后，可以参考项目的文档和示例Jupyter笔记本进行进一步的学习和操作。

yasa YASA (Yet Another Spindle Algorithm): a Python package to analyze polysomnographic sleep recordings. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ya/yasa