简易事件相关电位分析库(sec)安装与使用指南

简易事件相关电位分析库(sec)安装与使用指南

secSimple Event Correlator releases项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/sec1/sec

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项目目录结构及介绍

本指南将带您深入了解Simple Event-related Correlation（简称sec）这一开源项目。sec旨在简化事件相关电位(ERP)的数据处理与分析流程。以下是项目的典型目录结构及其主要组件简介：

sec/
|-- docs/                   # 文档资料，包括API参考和用户指南。
|-- examples/               # 示例代码，展示如何使用sec进行常见分析任务。
|-- sec/                    # 核心源码包，包含了主要的功能实现。
|   |-- __init__.py         # 初始化文件，导入模块时执行。
|   |-- analysis.py         # 数据分析核心函数。
|   |-- io.py               # 数据输入输出相关的函数。
|   -- preprocess.py        # 预处理数据的工具集。
|-- tests/                  # 单元测试文件夹，确保代码质量。
|-- setup.py                # 项目的安装脚本。
|-- README.md               # 项目快速入门和概述。
|-- LICENSE.txt             # 许可证文件，说明了软件使用的法律条款。

项目的启动文件介绍

在sec项目中，并没有一个直接定义为“启动文件”的传统入口点，因为这是一个Python库而不是独立应用。然而，若要开始使用此库，开发者或研究人员通常从导入sec包开始他们的脚本。例如，在一个新的Python脚本(analysis_example.py)的开头添加以下代码：

import sec

# 紧接着，你可以调用sec中的函数进行数据加载、预处理、分析等操作。

实际的工作流程通常从阅读docs中的指南或运行examples中的示例脚本开始。

项目的配置文件介绍

sec项目本身并未强制要求使用特定的配置文件来管理设置，它倾向于通过函数参数直接指定配置选项。这意味着配置细节通常是按需在脚本内部设定的，而非通过外部配置文件。不过，对于复杂的分析工作流，用户可以自行创建.py文件或使用YAML/JSON格式的文件来存储常量和配置项，然后在脚本中通过导入或读取这些文件来使用配置。

例如，如果您希望有一组固定的预处理参数，可以创建一个名为config.py的文件：

PREPROCESS_SETTINGS = {
    'filter_band': (1, 30),     # 设置滤波器的频率范围
    'epoch_time': (0, 1000),    # 定义epochs的时间窗口
}

ANALYSIS_PARAMETERS = {
    'stat_test': 't-test',       # 统计测试类型
}

之后，在您的主脚本中导入并使用这些配置：

from config import PREPROCESS_SETTINGS, ANALYSIS_PARAMETERS

# 使用配置进行数据预处理和分析
sec.preprocess(data, **PREPROCESS_SETTINGS)
result = sec.run_analysis(result, **ANALYSIS_PARAMETERS)

这样，虽然sec项目不直接提供内置的配置文件支持，用户仍可以通过组织代码和数据来实现灵活的配置管理。

secSimple Event Correlator releases项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/sec1/sec