Ripser.py:Python中的精简持久同调库安装与使用指南

Ripser.py:Python中的精简持久同调库安装与使用指南

项目地址:https://gitcode.com/gh_mirrors/ri/ripser.py


一、项目目录结构及介绍

Ripser.py项目遵循了清晰的Python包结构,其核心组件和相关资源分布在以下主要目录中:

  • src/ripser: 包含Python接口的核心实现。
  • test: 此目录存放了用于测试项目功能的单元测试和示例数据。
  • coveragerc: 配置代码覆盖率报告的文件。
  • gitattributes, gitignore: 版本控制相关的配置文件,用于忽略特定文件或指定文件属性。
  • readthedocs.yml: 文档构建配置,确保在ReadTheDocs上正确生成文档。
  • CHANGELOG.md: 记录了项目版本更新日志。
  • LICENSE.txt: 项目使用的MIT许可协议文本。
  • MANIFEST.in: 控制源码分发包中包含的非Python文件。
  • README.md: 项目的主要说明文档,提供了快速概述和基本使用说明。
  • pyproject.toml, setup.py: 这些文件对于pip安装至关重要,它们定义了项目的元数据和依赖项,以便于安装。
  • paper: 相关学术论文的资料或者引用信息。
  • bib: BibTeX条目,用于引用相关学术文献。

二、项目的启动文件介绍

Ripser.py本身没有传统意义上的“启动文件”,它通过Python模块方式使用。用户通过导入ripser模块来开始工作,例如,在Python脚本顶部引入:

import numpy as np
from ripser import ripser

随后,你可以直接调用ripser.ripser()函数进行计算,无需单独的启动操作。对于希望将其集成到更复杂应用中的开发者来说,这通常意味着将上述导入语句加入到自己的主程序中。

三、项目的配置文件介绍

Ripser.py的配置更多地体现在环境设置和安装时的选择上,而不是通过独立的配置文件来管理。然而,有两个特别需要注意的地方:

  • pip安装选项: 安装时,默认使用的是稳定且标准的配置。但如果你想利用更高效的哈希表(如robin_hood),你需要手动克隆并编译安装,这不是通过修改配置文件来完成的,而是通过命令行指令调整安装过程。

  • 自定义参数: 在使用ripser库时,你可以在调用函数时传递参数以定制化分析,这些参数直接在代码层面设定,比如阈值、维度限制等,并不涉及外部配置文件。

总结,Ripser.py倾向于通过代码交互来配置和执行任务,而非依赖于静态配置文件来定制行为。对于高级用法和特定设置,开发者应查阅详细的API文档和示例代码,以深入了解如何最佳利用这个强大的工具库。

ripser.py A Lean Persistent Homology Library for Python ripser.py 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/ri/ripser.py

创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考

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