MicroMeta 项目教程
1. 项目介绍
MicroMeta 是一个开源的软件平台,旨在为显微镜数据提供直观的可视化指南,以便捕获和管理显微镜元数据。该项目基于 4DN-BINA 扩展的 OME 数据模型,由全球社区倡议开发,并已在多个出版物中得到展示。
2. 项目快速启动
安装
首先,克隆项目仓库到本地:
git clone https://github.com/jkphl/micrometa.git
cd micrometa
运行
安装依赖并启动项目:
npm install
npm start
3. 应用案例和最佳实践
案例一:显微镜元数据管理
MicroMeta 可以用于管理显微镜的硬件规格和采集设置。例如,用户可以使用 Manage Instrument
模块来记录透射光、荧光、结构光和 TIRF 显微镜的硬件规格。
最佳实践
- 定期更新元数据:确保显微镜元数据始终是最新的,以便于数据的可追溯性和可重复性。
- 使用 JSON 文件:利用 JSON 文件来存储和管理元数据,便于导入和导出。
4. 典型生态项目
4DN-BINA
4DN-BINA 是一个与 MicroMeta 紧密合作的社区,专注于显微镜元数据的集成和协调。
OME
OME(Open Microscopy Environment)是一个支持显微镜数据标准化的社区,MicroMeta 与之紧密集成,以确保数据的一致性和互操作性。
通过这些生态项目的支持,MicroMeta 能够提供更加强大和灵活的显微镜元数据管理解决方案。
创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考