vcfanno 项目教程

vcfanno 项目教程

vcfanno annotate a VCF with other VCFs/BEDs/tabixed files 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/vc/vcfanno

1. 项目的目录结构及介绍

vcfanno/
├── api/
├── docs/
├── example/
├── scripts/
├── shared/
├── tests/
├── .gitignore
├── .travis.yml
├── LICENSE
├── Makefile
├── README.md
├── bench_test.go
├── go.mod
├── mkdocs.yml
└── vcfanno.go

目录结构介绍

• api/: 包含与API相关的文件和代码。
• docs/: 包含项目的文档文件。
• example/: 包含示例配置文件和脚本。
• scripts/: 包含用于构建和测试的脚本。
• shared/: 包含共享的代码和资源。
• tests/: 包含测试文件和测试数据。
• .gitignore: Git忽略文件列表。
• .travis.yml: Travis CI配置文件。
• LICENSE: 项目许可证文件。
• Makefile: 用于构建和测试的Makefile。
• README.md: 项目介绍和使用说明。
• bench_test.go: 性能测试文件。
• go.mod: Go模块依赖文件。
• mkdocs.yml: MkDocs配置文件。
• vcfanno.go: 项目的主启动文件。

2. 项目的启动文件介绍

vcfanno.go

vcfanno.go 是项目的主启动文件，负责初始化和启动 vcfanno 程序。该文件包含了主要的逻辑和功能实现，是整个项目的核心。

3. 项目的配置文件介绍

example/custom.lua

example/custom.lua 是一个示例配置文件，展示了如何使用 Lua 脚本进行自定义操作。用户可以根据需要修改此文件，以实现特定的功能。

mkdocs.yml

mkdocs.yml 是 MkDocs 的配置文件，用于生成项目的文档。用户可以通过修改此文件来定制文档的结构和内容。

.travis.yml

.travis.yml 是 Travis CI 的配置文件，用于自动化构建和测试。用户可以通过此文件配置 CI/CD 流程。

Makefile

Makefile 是项目的构建文件，包含了构建、测试和安装的命令。用户可以通过运行 make 命令来执行这些操作。

go.mod

go.mod 是 Go 模块的依赖文件，列出了项目所需的所有依赖项。用户可以通过此文件管理项目的依赖关系。

README.md

README.md 是项目的介绍文件，包含了项目的基本信息、安装步骤和使用说明。用户可以通过阅读此文件快速了解项目。

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