mediKanren 开源项目使用手册

mediKanren 开源项目使用手册

mediKanren Proof-of-concept for reasoning over the SemMedDB knowledge base, using miniKanren + heuristics + indexing. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/me/mediKanren

一、项目概述

mediKanren 是一个基于 miniKanren、结合启发式方法和索引机制的概念验证（PoC）项目，用于在医学知识图谱上进行推理。该项目隶属于NIH NCATS Biomedical Data Translator计划，特别适用于处理SemMedDB知识库，帮助研究人员通过逻辑编程方式探索药物、基因相互作用以及潜在治疗策略。

二、项目目录结构及介绍

mediKanren 的目录结构精心设计，便于维护和扩展。以下是主要目录的简介：

• attic: 这个目录包含了原始的原型代码，适合那些对项目历史发展感兴趣的开发者。
• medikanren: 实际工作中的原型版本，如果你准备运行或贡献代码，这个目录是你的主要关注点。
• medikanren2: 下一代原型，可能引入了新特性和优化。
• contrib: 这里存放的是外部贡献的案例、查询和应用，如果你寻找示例或者想要了解如何将mediKanren应用于不同场景，这里将是宝藏地。
• 核心文件如 LICENSE, Makefile, 和 README.md 分别提供了许可证信息、构建说明和项目介绍。

三、项目的启动文件介绍

尽管具体的启动命令或脚本没有直接提及，但根据常规开源软件习惯，启动mediKanren的入口很可能位于 medikanren 目录下的主程序文件中，可能是由Racket语言编写的某.rkt 文件。一般操作流程包括安装必要的依赖后，使用Racket的运行环境执行相应的启动命令，例如可能需要执行类似 racket path/to/main.rkt 的命令来启动项目。请注意，实际操作前应参照 README.md 文件获取确切的启动指令。

四、项目的配置文件介绍

mediKanren的配置细节未在提供的信息中明确指出。通常情况下，配置信息可以存在于以下几个位置或形式中：

• config.rkt 或相似命名的文件，如果存在，则可能存储了特定于项目的设置。
• 环境变量，项目可能会利用某些环境变量来调整行为。
• .env 文件，虽然这不是Racket标准实践，但在一些使用第三方库或者遵循跨语言实践的项目中可能见到。

为了正确配置和使用mediKanren，应当查看 README.md 文件，其中应该包含了关于如何设置任何必需的环境变量或特定配置的指导。

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在进行项目开发和使用时，请确保遵循项目的MIT许可证，并参考CONTRIBUTING.md文件（如果存在），以了解如何为项目贡献代码或报告问题。每个项目都有其特定的工作流和最佳实践，仔细阅读官方文档是成功使用和贡献的关键。

mediKanren Proof-of-concept for reasoning over the SemMedDB knowledge base, using miniKanren + heuristics + indexing. 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/me/mediKanren