记录链接工具RecordLinkage:强大的模块化Python记录链接套件
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RecordLinkage是一个功能强大且模块化的Python记录链接工具包,专为在单个或不同数据源之间的记录链接设计。该工具集提供了执行记录链接和去重复任务所需大部分工具。它包含索引方法、记录比较函数以及分类器。
本项目受到FREELY EXTENSIBLE BIOMEDICAL RECORD LINKAGE (FEBRL)的启发,FEBRL是一个出色的项目。与FEBRL不同的是,RecordLinkage使用pandas和numpy进行数据处理和计算。借助灵活且强大的pandas库,可以将记录链接过程轻松集成到现有的数据处理项目中。
该项目旨在构建一个易于扩展的记录链接框架。你能够轻松引入自定义的索引算法、相似度衡量标准以及分类器。
基本链接示例
首先导入recordlinkage
模块及其重要工具,并导入数据操作框架pandas。
import recordlinkage
import pandas
接着,将你的数据加载到pandas DataFrame中。
df_a = pandas.DataFrame(YOUR_FIRST_DATASET)
df_b = pandas.DataFrame(YOUR_SECOND_DATASET)
由于直接比较所有记录可能非常耗时,我们可以使用内置的索引技巧如**阻挡(Blocking)**来创建候选链接集合。以下例子中,只有姓氏相同的记录对才会被返回。
indexer = recordlinkage.Index()
indexer.block('surname')
candidate_links = indexer.index(df_a, df_b)
对于每个候选链接,你可以使用Compare类中的比较或相似性算法进行比较。
c = recordlinkage.Compare()
c.string('name_a', 'name_b', method='jarowinkler', threshold=0.85)
c.exact('sex', 'gender')
c.date('dob', 'date_of_birth')
c.string('str_name', 'streetname', method='damerau_levenshtein', threshold=0.7)
c.exact('place', 'placename')
c.numeric('income', 'income', method='gauss', offset=3, scale=3, missing_value=0.5)
# 生成特征向量
feature_vectors = c.compute(candidate_links, df_a, df_b)
然后,基于这些比较结果,利用分类算法(如逻辑回归分类器或无监督机器学习的ECM分类器)将候选链接分为匹配或不匹配的配对。
主要特性
RecordLinkage的主要特性包括:
- 使用简单的工具对数据进行清洗和标准化
- 通过智能索引方法(例如阻挡和排序邻域索引)生成记录对
- 对不同类型的变量(如字符串、数字和日期)使用多种比较和相似度衡量标准
- 提供多种分类算法,包括有监督和无监督算法
- 内置常见的记录链接评估工具
- 多个内置数据集
文档
最新的文档和API参考可在recordlinkage.readthedocs.org找到。文档中提供了一些基础用法示例,比如去重和两个DataFrame的链接。
安装
RecordLinkage要求Python 3.8或更高版本。使用pip轻松安装:
pip install recordlinkage
工具包依赖于流行包,如Pandas、Numpy、Scipy以及Scikit-learn。完整的依赖列表可以在安装指南中找到,还有推荐和可选的依赖项。
许可证
该记录链接工具的许可证是BSD-3-Clause。
引用
如果在学术背景下使用此工具,请予以引用。确保DOI和版本号与已安装版本匹配。引用样式可以在出版商网站上找到。引用信息如下:
@software{de_bruin_j_2019_3559043,
author = {De Bruin, J},
title = {{Python Record Linkage Toolkit: A toolkit for
record linkage and duplicate detection in Python}},
month = dec,
year = 2019,
publisher = {Zenodo},
version = {v0.14},
doi = {10.5281/zenodo.3559043},
url = {https://doi.org/10.5281/zenodo.3559043}
}
需要帮助?
如果你在记录链接代码或问题上遇到困难,或者有任何其他问题,欢迎发送邮件至jonathandebruinos@gmail.com咨询。
结论
RecordLinkage不仅简化了记录链接的过程,而且其灵活性使其成为数据整合、去重和发现潜在关联的理想选择。无论你是数据科学家、研究员还是开发人员,RecordLinkage都能以其强大的功能和易用性,帮助你在数据管理领域取得突破。立即开始使用RecordLinkage,提升你的数据分析效率吧!
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创作声明:本文部分内容由AI辅助生成(AIGC),仅供参考