开源项目推荐：dittoSeq

开源项目推荐：dittoSeq

dittoSeq Color blindness friendly visualization of single-cell and bulk RNA-sequencing data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/di/dittoSeq

1. 项目基础介绍及主要编程语言

项目名称：dittoSeq

项目简介：dittoSeq 是一个旨在帮助研究人员分析单细胞和批量 RNA 测序数据的开源项目。该项目提供了一系列的函数和工具，特别适合于初学者、有经验的科研人员以及色盲程序员使用。

主要编程语言：R

2. 项目的核心功能

• 数据可视化：dittoSeq 提供了多种可视化功能，包括但不限于散点图、热图、条形图等，这些可视化工具都是色盲友好的。
• 数据处理：项目包含了用于处理单细胞和批量 RNA 测序数据的函数，支持多种生物信息学包，如 Seurat、scran、DESeq2 等。
• 易于使用：通过最小化的编码输入即可生成易于阅读的图表，同时允许用户进行足够的操作以生成提交质量的图形。
• 数据访问：项目使得底层数据的访问变得简单，便于用户提交给期刊或为图形添加额外的层次。

3. 项目最近更新的功能

• 多模态功能支持：新版本增强了多模态数据的可视化功能，允许在单个图表中展示来自多种模态的标记。
• 图表分类显示：在 dittoDotPlot() 中增加了对变量/标记分类显示的支持，以及坐标轴交换的功能。
• 三色标尺：dittoDotPlot() 支持添加中点颜色到颜色标尺，允许用户选择使用两色或三色标尺。
• 标签调整：在 dittoDimPlot()、dittoScatterPlot() 等函数中增加了对标签位置的额外控制。
• 异常值大小控制：在 boxplot_outlier_size 输入中增加了对异常值形状大小的控制。
• 小提琴图数据量分位数显示：在 vlnplot_quantiles 输入中增加了对小提琴图数据分位数的线条显示。

这些更新增强了 dittoSeq 的功能和灵活性，使其成为单细胞和批量 RNA 测序数据分析的强大工具。

dittoSeq Color blindness friendly visualization of single-cell and bulk RNA-sequencing data 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/di/dittoSeq