DeepMedic 项目推荐

DeepMedic 项目推荐

deepmedic Efficient Multi-Scale 3D Convolutional Neural Network for Segmentation of 3D Medical Scans 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/de/deepmedic

1. 项目基础介绍和主要编程语言

DeepMedic 是一个专注于医学影像分割的开源项目，主要使用 Python 编程语言。该项目旨在通过深度学习技术，特别是多尺度三维卷积神经网络（3D CNNs），来高效地进行三维医学扫描的分割。DeepMedic 的设计目标是使深度学习在医学影像领域的应用更加便捷和高效。

2. 项目核心功能

DeepMedic 的核心功能包括：

• 多尺度三维卷积神经网络：项目提供了一个高效的多尺度三维卷积神经网络架构，能够处理多模态的医学影像数据。
• 医学影像分割：通过训练神经网络，DeepMedic 能够自动检测和分割医学影像中的感兴趣结构。
• NIFTI 图像处理：项目支持 NIFTI 格式的医学影像数据，使得其在生物医学任务中的应用更加广泛。
• 灵活的配置和训练：用户可以通过配置文件灵活地调整网络结构和训练参数，以适应不同的医学影像分割任务。

3. 项目最近更新的功能

DeepMedic 最近更新的功能包括：

• 2021年1月（v0.8.4）：增加了通过 CSV 数据框接收输入文件（图像、标签、ROI 掩码）的功能，尽管尚未实际使用。前端模块进行了重构，以提高可读性。
• 2020年5月（v0.8.3）：恢复了旧的算法（pre-v0.8.2）用于获取下采样的上下文，以保持与之前版本的完全兼容性。
• 2020年4月（v0.8.2）：为了兼容 TensorFlow 2.0.0 和 TF1.15.0，进行了重大代码库更改。重构了 /deepmedic/neuralnet 模块，改进了采样（多类别时更快）和日志记录。配置文件也进行了更新。
• 2019年11月（v0.8.0）：增加了将指标记录到 TensorBoard 的功能，能够在训练过程中动态归一化输入（默认禁用）。仅支持 z-score 归一化。对训练、测试和采样进行了重构和美化。
• 2019年6月（v0.7.4）：增加了通过仿射变换进行数据增强的功能，包括旋转和缩放（默认关闭，因为会减慢训练速度）。改进了非存在类别的样本重新分配和采样代码的重构。增加了更宽的 DM 模型配置，似乎在一些研究中表现更好。

这些更新使得 DeepMedic 在处理复杂医学影像分割任务时更加高效和灵活。

deepmedic Efficient Multi-Scale 3D Convolutional Neural Network for Segmentation of 3D Medical Scans 项目地址: https://gitcode.com/gh_mirrors/de/deepmedic