服务器共享软件安装

本文介绍了BLAST软件的下载及安装流程,包括从NCBI官方FTP站点获取软件、解压安装包以及设置环境变量等步骤,使用户能够在服务器环境下顺利使用BLAST进行生物信息学分析。

摘要生成于 C知道 ,由 DeepSeek-R1 满血版支持, 前往体验 >


1 软件下载

blast:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/release/LATEST

blast+:ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blassst+/LATEST

下载经过编译的版本,下载下来以后,在服务器上解压就能够使用了,如果大不开就换浏览器

2 软件安装

2.1 解压

2.2 设置环境变量

我们在share中的软件,所有人都能通过修改环境变量来使用。我们把软件安装在share中 服务器并不会知道,所以要设置环境变量,告诉服务器,安装软件的位置。

修改方法:在自己的home目录下 view->Show Hidden Files.然后找到两个文件: .bashprofile .bashrc。然后分别在里面添加一行(添加的是执行程序所在的文件夹):

1:  export PATH=/mnt/share/ncbi-blast-2.2.28+/bin:$PATH
2:  #这里是添加的blast+的环境变量
3:  export PATH=/mnt/share/blast-2.2.26/bin:$PATH
4:  

修改好,保存,然后就可以在任何文件夹里使用了。

Date: 2013-05-15 13:09:56 CST

Author: gaorongchao

Org version 7.8.11 with Emacs version 24

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